RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000062829.8

Hoxa6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa6, Length 874 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 1700025F22RikQ9D9Y7 111 aa13.54□□□□□ -0.24
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cd200r1Q9ES57 326 aa13.54□□□□□ -0.24
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Hils1Q9QYL0 170 aa13.54□□□□□ -0.24
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Bex1Q9R224 128 aa13.54□□□□□ -0.24
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Hivep3A2A884 2348 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm14597A2CFG5 200 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Vmn1r180B9EK86 305 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 IfnabL7MTU6 190 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Shisa3Q3UPR0 238 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr669Q8VGU9 317 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Basp1Q91XV3 226 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cnn3Q9DAW9 330 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gnpnat1Q9JK38 184 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ccl24Q9JKC0 119 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pla2g2dQ9WVF6 144 aa13.53□□□□□ -0.24
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm45871A0A1B0GRI9 540 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Platr25A0A1Y7VIZ1 466 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm436B1AVU6 407 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Btbd35f24J3QNQ5 498 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Atp4bP50992 294 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pax6P63015 422 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr1507Q0VEP0 313 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Q3TEI4 1023 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ppp1r3cQ7TMB3 317 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pramel5Q7TPY4 500 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 OtosQ8R448 89 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr530Q8VFE8 307 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Slc22a7Q91WU2 540 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Yif1aQ91XB7 293 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 HaghQ99KB8 309 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 ManfQ9CXI5 179 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 1700013G24RikQ9DAC6 286 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ropn1lQ9EQ00 218 aa13.52□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ighv6-5A0A0A6YWS9 119 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rd3lB2RV38 197 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm2381G3UY53 305 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Lin7bO88951 207 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 BsgP18572 389 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Egr3P43300 387 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Defb30Q30KN4 75 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Trdv4Q5R1A3 115 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rab3ipQ68EF0 428 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Thap4Q6P3Z3 569 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Spock3Q8BKV0 436 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr1250Q8VGM3 314 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr1270Q8VGP3 304 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rassf1Q99MK9 340 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Flywch2Q9CQE9 139 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Znf22Q9ERU3 237 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Opn3Q9WUK7 400 aa13.51□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 A930017K11RikE0CXQ2 571 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Vmn2r124K7N789 855 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Prdx6O08709 224 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pdcd6P12815 191 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tnfrsf1aP25118 454 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rab7aP51150 207 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Slc7a15Q50E62 488 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 ScocQ78YZ6 125 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr1252Q7TQZ2 314 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr1219Q7TR04 311 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rnf170Q8CBG9 286 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr120Q8VFQ2 330 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr131Q8VGC8 314 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tmprss11dQ8VHK8 417 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 DenrQ9CQJ6 198 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mfsd4b2Q9D8I5 366 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr1156A2AVC3 323 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Esp16A8R0U9 85 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ankrd29D3YVV3 309 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Krtap24-1G3X9A2 248 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 P01660 111 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 P04940 107 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 P04941 107 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 NppaP05125 152 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fgf2P15655 154 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Edn2P22389 175 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gabarapl2P60521 117 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tmem69Q3KQJ0 245 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm5127Q3UQH6 212 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr113Q8VEU4 312 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr1347Q8VF33 319 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr123Q8VFQ1 309 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tmbim7Q9D592 302 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ntn3Q9R1A3 580 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Htr6Q9R1C8 440 aa13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Trbv20A0A0B4J1H5 111 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rhox2fA2ANE0 191 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 S100zB9EJL3 99 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm21560D3Z7A4 205 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr1406E9Q8X1 310 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr1218L7MU54 311 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm8050L7N2E3 205 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Klrd1O54707 179 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fcn2O70497 314 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Bcl6bO88282 474 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 RelP15307 587 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rps27aP62983 156 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Q08AU9 97 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.2 ms