Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK38

Gnpnat1, Glucosamine 6-phosphate N-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpnat1Q9JK38 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Gnpnat1Q9JK38 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gnpnat1Q9JK38 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gnpnat1Q9JK38 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gnpnat1Q9JK38 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gnpnat1Q9JK38 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Gnpnat1Q9JK38 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gnpnat1Q9JK38 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gnpnat1Q9JK38 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gnpnat1Q9JK38 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gnpnat1Q9JK38 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gnpnat1Q9JK38 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gnpnat1Q9JK38 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gnpnat1Q9JK38 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gnpnat1Q9JK38 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gnpnat1Q9JK38 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gnpnat1Q9JK38 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gnpnat1Q9JK38 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gnpnat1Q9JK38 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gnpnat1Q9JK38 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gnpnat1Q9JK38 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Gnpnat1Q9JK38 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gnpnat1Q9JK38 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gnpnat1Q9JK38 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gnpnat1Q9JK38 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gnpnat1Q9JK38 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gnpnat1Q9JK38 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gnpnat1Q9JK38 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gnpnat1Q9JK38 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gnpnat1Q9JK38 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gnpnat1Q9JK38 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gnpnat1Q9JK38 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gnpnat1Q9JK38 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gnpnat1Q9JK38 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gnpnat1Q9JK38 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gnpnat1Q9JK38 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gnpnat1Q9JK38 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gnpnat1Q9JK38 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gnpnat1Q9JK38 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gnpnat1Q9JK38 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gnpnat1Q9JK38 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gnpnat1Q9JK38 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gnpnat1Q9JK38 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gnpnat1Q9JK38 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gnpnat1Q9JK38 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gnpnat1Q9JK38 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gnpnat1Q9JK38 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gnpnat1Q9JK38 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gnpnat1Q9JK38 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gnpnat1Q9JK38 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gnpnat1Q9JK38 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gnpnat1Q9JK38 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gnpnat1Q9JK38 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gnpnat1Q9JK38 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gnpnat1Q9JK38 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gnpnat1Q9JK38 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gnpnat1Q9JK38 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gnpnat1Q9JK38 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gnpnat1Q9JK38 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gnpnat1Q9JK38 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gnpnat1Q9JK38 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gnpnat1Q9JK38 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gnpnat1Q9JK38 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gnpnat1Q9JK38 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gnpnat1Q9JK38 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gnpnat1Q9JK38 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gnpnat1Q9JK38 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gnpnat1Q9JK38 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gnpnat1Q9JK38 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gnpnat1Q9JK38 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gnpnat1Q9JK38 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gnpnat1Q9JK38 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gnpnat1Q9JK38 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gnpnat1Q9JK38 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gnpnat1Q9JK38 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gnpnat1Q9JK38 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gnpnat1Q9JK38 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gnpnat1Q9JK38 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gnpnat1Q9JK38 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gnpnat1Q9JK38 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gnpnat1Q9JK38 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gnpnat1Q9JK38 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gnpnat1Q9JK38 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gnpnat1Q9JK38 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gnpnat1Q9JK38 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gnpnat1Q9JK38 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gnpnat1Q9JK38 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gnpnat1Q9JK38 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gnpnat1Q9JK38 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gnpnat1Q9JK38 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gnpnat1Q9JK38 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gnpnat1Q9JK38 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gnpnat1Q9JK38 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gnpnat1Q9JK38 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gnpnat1Q9JK38 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gnpnat1Q9JK38 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gnpnat1Q9JK38 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gnpnat1Q9JK38 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gnpnat1Q9JK38 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gnpnat1Q9JK38 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms