Protein–RNA interactions for Protein: P60521

Gabarapl2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabarapl2P60521 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Gabarapl2P60521 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Gabarapl2P60521 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Gabarapl2P60521 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Gabarapl2P60521 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
Gabarapl2P60521 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Gabarapl2P60521 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,67■■■□□ 2,34
Gabarapl2P60521 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gabarapl2P60521 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Gabarapl2P60521 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Gabarapl2P60521 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Gabarapl2P60521 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Gabarapl2P60521 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Gabarapl2P60521 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Gabarapl2P60521 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Gabarapl2P60521 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Gabarapl2P60521 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Gabarapl2P60521 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,14■■■□□ 2,09
Gabarapl2P60521 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Gabarapl2P60521 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Gabarapl2P60521 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Gabarapl2P60521 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Gabarapl2P60521 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Gabarapl2P60521 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Gabarapl2P60521 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Gabarapl2P60521 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Gabarapl2P60521 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,31■■□□□ 1,96
Gabarapl2P60521 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Gabarapl2P60521 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Gabarapl2P60521 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Gabarapl2P60521 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Gabarapl2P60521 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
Gabarapl2P60521 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Gabarapl2P60521 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Gabarapl2P60521 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Gabarapl2P60521 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Gabarapl2P60521 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Gabarapl2P60521 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,96■■□□□ 1,91
Gabarapl2P60521 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Gabarapl2P60521 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Gabarapl2P60521 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Gabarapl2P60521 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Gabarapl2P60521 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
Gabarapl2P60521 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Gabarapl2P60521 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Gabarapl2P60521 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Gabarapl2P60521 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Gabarapl2P60521 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Gabarapl2P60521 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Gabarapl2P60521 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Gabarapl2P60521 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Gabarapl2P60521 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Gabarapl2P60521 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Gabarapl2P60521 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Gabarapl2P60521 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Gabarapl2P60521 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Gabarapl2P60521 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Gabarapl2P60521 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Gabarapl2P60521 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Gabarapl2P60521 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Gabarapl2P60521 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Gabarapl2P60521 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Gabarapl2P60521 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Gabarapl2P60521 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Gabarapl2P60521 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Gabarapl2P60521 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Gabarapl2P60521 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,99■■□□□ 1,75
Gabarapl2P60521 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Gabarapl2P60521 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Gabarapl2P60521 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Gabarapl2P60521 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Gabarapl2P60521 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Gabarapl2P60521 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Gabarapl2P60521 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Gabarapl2P60521 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Gabarapl2P60521 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Gabarapl2P60521 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Gabarapl2P60521 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gabarapl2P60521 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gabarapl2P60521 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gabarapl2P60521 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gabarapl2P60521 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gabarapl2P60521 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gabarapl2P60521 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gabarapl2P60521 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gabarapl2P60521 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gabarapl2P60521 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Gabarapl2P60521 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Gabarapl2P60521 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gabarapl2P60521 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gabarapl2P60521 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Gabarapl2P60521 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gabarapl2P60521 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gabarapl2P60521 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Gabarapl2P60521 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Gabarapl2P60521 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Gabarapl2P60521 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Gabarapl2P60521 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Gabarapl2P60521 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gabarapl2P60521 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms