Protein–RNA interactions for Protein: P15307

Rel, Proto-oncogene c-Rel, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelP15307 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RelP15307 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RelP15307 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RelP15307 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RelP15307 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RelP15307 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RelP15307 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RelP15307 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RelP15307 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RelP15307 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RelP15307 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RelP15307 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RelP15307 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RelP15307 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RelP15307 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RelP15307 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RelP15307 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RelP15307 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RelP15307 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RelP15307 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RelP15307 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RelP15307 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RelP15307 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RelP15307 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RelP15307 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RelP15307 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RelP15307 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RelP15307 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RelP15307 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RelP15307 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RelP15307 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RelP15307 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RelP15307 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RelP15307 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RelP15307 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RelP15307 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RelP15307 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RelP15307 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RelP15307 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RelP15307 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RelP15307 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RelP15307 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RelP15307 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RelP15307 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RelP15307 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
RelP15307 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RelP15307 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RelP15307 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RelP15307 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RelP15307 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RelP15307 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RelP15307 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RelP15307 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RelP15307 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RelP15307 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RelP15307 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RelP15307 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RelP15307 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RelP15307 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RelP15307 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RelP15307 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RelP15307 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RelP15307 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RelP15307 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RelP15307 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RelP15307 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RelP15307 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RelP15307 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RelP15307 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RelP15307 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RelP15307 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RelP15307 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RelP15307 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RelP15307 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RelP15307 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RelP15307 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RelP15307 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RelP15307 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RelP15307 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RelP15307 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RelP15307 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RelP15307 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RelP15307 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RelP15307 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RelP15307 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RelP15307 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RelP15307 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RelP15307 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RelP15307 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RelP15307 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RelP15307 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RelP15307 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RelP15307 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RelP15307 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RelP15307 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RelP15307 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RelP15307 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RelP15307 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RelP15307 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RelP15307 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms