Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ScocQ78YZ6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ScocQ78YZ6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ScocQ78YZ6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ScocQ78YZ6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ScocQ78YZ6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ScocQ78YZ6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ScocQ78YZ6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ScocQ78YZ6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ScocQ78YZ6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ScocQ78YZ6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ScocQ78YZ6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ScocQ78YZ6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ScocQ78YZ6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ScocQ78YZ6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ScocQ78YZ6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ScocQ78YZ6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ScocQ78YZ6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ScocQ78YZ6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ScocQ78YZ6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ScocQ78YZ6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ScocQ78YZ6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ScocQ78YZ6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ScocQ78YZ6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ScocQ78YZ6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ScocQ78YZ6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ScocQ78YZ6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ScocQ78YZ6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ScocQ78YZ6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ScocQ78YZ6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ScocQ78YZ6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ScocQ78YZ6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ScocQ78YZ6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ScocQ78YZ6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ScocQ78YZ6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ScocQ78YZ6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ScocQ78YZ6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ScocQ78YZ6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ScocQ78YZ6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ScocQ78YZ6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ScocQ78YZ6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ScocQ78YZ6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ScocQ78YZ6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ScocQ78YZ6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ScocQ78YZ6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ScocQ78YZ6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ScocQ78YZ6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ScocQ78YZ6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ScocQ78YZ6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ScocQ78YZ6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ScocQ78YZ6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ScocQ78YZ6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ScocQ78YZ6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ScocQ78YZ6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ScocQ78YZ6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ScocQ78YZ6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ScocQ78YZ6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ScocQ78YZ6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ScocQ78YZ6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ScocQ78YZ6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ScocQ78YZ6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ScocQ78YZ6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ScocQ78YZ6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ScocQ78YZ6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ScocQ78YZ6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ScocQ78YZ6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ScocQ78YZ6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ScocQ78YZ6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ScocQ78YZ6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ScocQ78YZ6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ScocQ78YZ6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ScocQ78YZ6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ScocQ78YZ6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ScocQ78YZ6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ScocQ78YZ6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ScocQ78YZ6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ScocQ78YZ6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ScocQ78YZ6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ScocQ78YZ6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ScocQ78YZ6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ScocQ78YZ6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ScocQ78YZ6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ScocQ78YZ6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ScocQ78YZ6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ScocQ78YZ6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ScocQ78YZ6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ScocQ78YZ6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ScocQ78YZ6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ScocQ78YZ6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ScocQ78YZ6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ScocQ78YZ6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ScocQ78YZ6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ScocQ78YZ6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ScocQ78YZ6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ScocQ78YZ6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ScocQ78YZ6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ScocQ78YZ6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ScocQ78YZ6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ScocQ78YZ6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ScocQ78YZ6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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