Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
ScocQ78YZ6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
ScocQ78YZ6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
ScocQ78YZ6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
ScocQ78YZ6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
ScocQ78YZ6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
ScocQ78YZ6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
ScocQ78YZ6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
ScocQ78YZ6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
ScocQ78YZ6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
ScocQ78YZ6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
ScocQ78YZ6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
ScocQ78YZ6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
ScocQ78YZ6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
ScocQ78YZ6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
ScocQ78YZ6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
ScocQ78YZ6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,22■■□□□ 1,95
ScocQ78YZ6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
ScocQ78YZ6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
ScocQ78YZ6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
ScocQ78YZ6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
ScocQ78YZ6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
ScocQ78YZ6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
ScocQ78YZ6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,91■■□□□ 1,9
ScocQ78YZ6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
ScocQ78YZ6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
ScocQ78YZ6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
ScocQ78YZ6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
ScocQ78YZ6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
ScocQ78YZ6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
ScocQ78YZ6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,82
ScocQ78YZ6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
ScocQ78YZ6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
ScocQ78YZ6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,31■■□□□ 1,8
ScocQ78YZ6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
ScocQ78YZ6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
ScocQ78YZ6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
ScocQ78YZ6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
ScocQ78YZ6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,16■■□□□ 1,78
ScocQ78YZ6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
ScocQ78YZ6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
ScocQ78YZ6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
ScocQ78YZ6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
ScocQ78YZ6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
ScocQ78YZ6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
ScocQ78YZ6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
ScocQ78YZ6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
ScocQ78YZ6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
ScocQ78YZ6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
ScocQ78YZ6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
ScocQ78YZ6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
ScocQ78YZ6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
ScocQ78YZ6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
ScocQ78YZ6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
ScocQ78YZ6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
ScocQ78YZ6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
ScocQ78YZ6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
ScocQ78YZ6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
ScocQ78YZ6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
ScocQ78YZ6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
ScocQ78YZ6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
ScocQ78YZ6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
ScocQ78YZ6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
ScocQ78YZ6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
ScocQ78YZ6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
ScocQ78YZ6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
ScocQ78YZ6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
ScocQ78YZ6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
ScocQ78YZ6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
ScocQ78YZ6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
ScocQ78YZ6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
ScocQ78YZ6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
ScocQ78YZ6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
ScocQ78YZ6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
ScocQ78YZ6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
ScocQ78YZ6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
ScocQ78YZ6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
ScocQ78YZ6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25■■□□□ 1,59
ScocQ78YZ6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
ScocQ78YZ6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
ScocQ78YZ6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
ScocQ78YZ6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
ScocQ78YZ6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
ScocQ78YZ6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
ScocQ78YZ6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
ScocQ78YZ6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,83■■□□□ 1,57
ScocQ78YZ6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
ScocQ78YZ6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,81■■□□□ 1,56
ScocQ78YZ6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
ScocQ78YZ6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
ScocQ78YZ6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
ScocQ78YZ6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24,8■■□□□ 1,56
ScocQ78YZ6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,78■■□□□ 1,56
ScocQ78YZ6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
ScocQ78YZ6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,71■■□□□ 1,55
ScocQ78YZ6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,55
ScocQ78YZ6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
ScocQ78YZ6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
ScocQ78YZ6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
ScocQ78YZ6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
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