Protein–RNA interactions for Protein: Q9D592

Tmbim7, RIKEN cDNA 4930511M11, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim7Q9D592 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Tmbim7Q9D592 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmbim7Q9D592 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmbim7Q9D592 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmbim7Q9D592 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmbim7Q9D592 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmbim7Q9D592 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmbim7Q9D592 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmbim7Q9D592 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmbim7Q9D592 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmbim7Q9D592 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmbim7Q9D592 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmbim7Q9D592 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmbim7Q9D592 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmbim7Q9D592 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmbim7Q9D592 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmbim7Q9D592 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmbim7Q9D592 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmbim7Q9D592 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmbim7Q9D592 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmbim7Q9D592 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmbim7Q9D592 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmbim7Q9D592 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmbim7Q9D592 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmbim7Q9D592 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmbim7Q9D592 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmbim7Q9D592 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmbim7Q9D592 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmbim7Q9D592 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmbim7Q9D592 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmbim7Q9D592 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmbim7Q9D592 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmbim7Q9D592 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmbim7Q9D592 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmbim7Q9D592 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmbim7Q9D592 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmbim7Q9D592 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmbim7Q9D592 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmbim7Q9D592 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmbim7Q9D592 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmbim7Q9D592 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmbim7Q9D592 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmbim7Q9D592 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmbim7Q9D592 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmbim7Q9D592 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmbim7Q9D592 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmbim7Q9D592 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmbim7Q9D592 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmbim7Q9D592 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmbim7Q9D592 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmbim7Q9D592 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmbim7Q9D592 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmbim7Q9D592 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmbim7Q9D592 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmbim7Q9D592 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmbim7Q9D592 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmbim7Q9D592 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmbim7Q9D592 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmbim7Q9D592 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmbim7Q9D592 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmbim7Q9D592 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmbim7Q9D592 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmbim7Q9D592 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmbim7Q9D592 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmbim7Q9D592 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmbim7Q9D592 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmbim7Q9D592 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmbim7Q9D592 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmbim7Q9D592 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmbim7Q9D592 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmbim7Q9D592 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmbim7Q9D592 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmbim7Q9D592 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmbim7Q9D592 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmbim7Q9D592 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmbim7Q9D592 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmbim7Q9D592 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmbim7Q9D592 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmbim7Q9D592 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmbim7Q9D592 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmbim7Q9D592 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmbim7Q9D592 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmbim7Q9D592 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmbim7Q9D592 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmbim7Q9D592 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmbim7Q9D592 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmbim7Q9D592 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmbim7Q9D592 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmbim7Q9D592 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmbim7Q9D592 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmbim7Q9D592 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmbim7Q9D592 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmbim7Q9D592 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmbim7Q9D592 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmbim7Q9D592 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmbim7Q9D592 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmbim7Q9D592 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmbim7Q9D592 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmbim7Q9D592 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmbim7Q9D592 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms