RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 AADACP22760 399 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 PRSS8Q16651 343 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 BEST4Q8NFU0 473 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 DCUN1D4Q92564 292 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 OR5B12Q96R08 314 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 PALMDQ9NP74 551 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 A0A087WW49 117 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 TRGV3P03979 118 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 RPS19P39019 145 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 CBX5P45973 191 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 TPPP2P59282 170 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 CDK10Q15131 360 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 ACSM6Q6P461 480 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 MS4A10Q96PG2 267 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 ZMAT4Q9H898 229 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 FCGR3BO75015 233 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 KCTD9Q7L273 389 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 MMD2Q8IY49 270 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 GVQW1Q8N7I0 195 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 OR5T1Q8NG75 326 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 OR5AP2Q8NGF4 316 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 USMG5Q96IX5 58 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 CMTM3Q96MX0 182 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-221ENST00000550734 MSGN1A6NI15 193 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 LY86O95711 162 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 PPYP01298 95 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 IGHV3-11P01762 117 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 OR9G9P0C7N8 305 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 ZP3P21754 424 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 FCGR2CP31995 323 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 MAS1LP35410 378 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 TGFBR1P36897 503 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 KIR2DS2P43631 304 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 SLURP1P55000 103 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 ARPC4P59998 168 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 UBE2NLQ5JXB2 153 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 ZNF343Q6P1L6 599 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 MFSD4AQ8N468 514 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 OR4S2Q8NH73 311 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 SNAPC3Q92966 411 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 SPIN2AQ99865 258 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.83□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.82□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8.82□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 J3QRK9 145 aa8.82□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 NAT1P18440 290 aa8.82□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 TNXAQ16473 311 aa8.82□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 KLK9Q2XQG4 91 aa8.82□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.82□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.82□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.82□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 OR13F1Q8NGS4 319 aa8.82□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.82□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.82□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.82□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.82□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.81□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 SAP30O75446 220 aa8.81□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 ACTL6BO94805 426 aa8.81□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 KBTBD11O94819 623 aa8.81□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 OR2A4O95047 310 aa8.81□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 HRASP01112 189 aa8.81□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 APOA1P02647 267 aa8.81□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-221ENST00000550734 FGF2P09038 288 aa8.81□□□□□ -1
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