RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W ERG12P07277 443 aa10.63□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W SLY1P22213 666 aa10.63□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W COT1P32798 439 aa10.63□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W PCM1P38628 557 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W DIA4P38705 446 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W CAB2P40506 365 aa10.63□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W LAM5P43560 674 aa10.63□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W SAD1P43589 448 aa10.63□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W NUP84P52891 726 aa10.63□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W YGL108CP53139 140 aa10.63□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W PUS2P53167 370 aa10.63□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W AVL9Q12500 764 aa10.63□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W TUB2P02557 457 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W IMA3P0CW40 589 aa10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W IMA4P0CW41 589 aa10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W YER152CP10356 443 aa10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W TRX1P22217 103 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W YSC84P32793 468 aa10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W KES1P35844 434 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W SRL3P36167 246 aa10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W SCC4P40090 624 aa10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W KHA1P40309 873 aa10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W SBE2P42223 864 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W ARC1P46672 376 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W TEL2P53038 688 aa10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W YDR179W-AQ03983 463 aa10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W IMA2Q08295 589 aa10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W HRT3Q12347 344 aa10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W GIS3Q12418 502 aa10.62□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W FKS1P38631 1876 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W MPH2P0CD99 609 aa10.61□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W ATR1P13090 542 aa10.61□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W COX11P19516 300 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W PRP6P19735 899 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W TFC1P32367 649 aa10.61□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W NUF2P33895 451 aa10.61□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W MAD3P47074 515 aa10.61□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W MTC3P53077 123 aa10.61□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W TVP15Q03860 143 aa10.61□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W YMR074CQ04773 145 aa10.61□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W ATG11Q12527 1178 aa10.61□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W ECM3Q99252 613 aa10.61□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W TEF1P02994 458 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W MEF1P25039 761 aa10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W CDC20P26309 610 aa10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W RAD16P31244 790 aa10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W SPR1P32603 445 aa10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W CTP1P38152 299 aa10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W SLM4P38247 162 aa10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W FES1P38260 290 aa10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W YJL206CP39529 758 aa10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W FLC2P39719 783 aa10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W SAW1P39735 261 aa10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W SSP120P39931 234 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W SIT1P39980 628 aa10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W RBL2P48606 106 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W UTP8P53276 713 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W SFB2P53953 876 aa10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W YKR005CQ02203 525 aa10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W GUD1Q07729 489 aa10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W SGT2Q12118 346 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W ADF1Q2V2Q1 113 aa10.6□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W MST1P07236 462 aa10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W GPA2P10823 449 aa10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W RAD18P10862 487 aa10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W CDC3P32457 520 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W BCS1P32839 456 aa10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W RIM2P38127 377 aa10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W ERT1P38140 529 aa10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W YDR089WP38966 869 aa10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W SAH1P39954 449 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W PEP8P40335 379 aa10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W ALY2P47029 1046 aa10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W COG2P53271 262 aa10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W DCP2P53550 970 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W YNL247WP53852 767 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W TEP1P53916 434 aa10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W NDL1Q06568 189 aa10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W CUE5Q08412 411 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W RGR1P19263 1082 aa10.58□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W CNA1P23287 553 aa10.58□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W ADY2P25613 283 aa10.58□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W RIB7P33312 244 aa10.58□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W STV1P37296 890 aa10.58□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W GIP1P38229 639 aa10.58□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W CBR1P38626 284 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W ARB1P40024 610 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W UTP7P40055 554 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W CHS6P40955 746 aa10.58□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SNZ3P43545 298 aa10.58□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W AVT1P47082 602 aa10.58□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SNZ2P53824 298 aa10.58□□□□□ -0.72
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