RNA–Protein interactions for RNA: YPR013C

CMR3, Transcript of Putative zinc finger protein, yeast

Gene CMR3, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMR3	YPR013C	URA3	P03962	267 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	TFC3	P34111	1160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	YBR138C	P38277	524 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	IFA38	P38286	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	ECM1	P39715	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	YEL068C	P39977	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	MET12	P46151	657 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	SGM1	P47166	707 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	COX18	P53239	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	MDR1	P53258	950 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	ARA2	Q04212	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	TFC6	Q06339	672 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	VPS36	Q06696	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	SEM1	O94742	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	PCK1	P10963	549 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	HMG2	P12684	1045 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	BET2	P20133	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	PRE4	P30657	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	RAD16	P31244	790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	YPT7	P32939	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	SIC1	P38634	284 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	BCD1	P38772	366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	MSS4	P38994	779 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	RIC1	P40395	1056 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	BIT61	P47041	543 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	TAH11	P47112	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	ACS1	Q01574	713 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	HIS5	P07172	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	CDC16	P09798	840 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	ARG1	P22768	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	RIT1	P23796	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	CBF2	P32504	956 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	MTC7	P32633	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	NUP120	P35729	1037 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	KAE1	P36132	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	UBS1	P38290	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	YHR112C	P38716	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	YNL195C	P40168	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	PRM2	P40534	656 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	IMA1	P53051	589 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	SPO1	P53541	631 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	TAH18	Q12181	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	KIN82	P25341	720 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	SET3	P36124	751 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	CAB2	P40506	365 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	CHA4	P43634	648 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	INP52	P50942	1183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	NCS6	P53088	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	ORC3	P54790	616 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	TIM50	Q02776	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	SNO4	Q04902	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	HSP32	Q08992	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	SCM3	Q12334	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	SEC15	P22224	910 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	PGS1	P25578	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	CNS1	P33313	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	GSM1	P42950	618 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	GCV2	P49095	1034 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	YGR130C	P53278	816 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	YAP1802	P53309	568 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	MRPL19	P53875	158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	ATG21	Q02887	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	NRG1	Q03125	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	PLB2	Q03674	706 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	ROT1	Q03691	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	PEX19	Q07418	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	POM34	Q12445	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	MET8	P15807	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMR3	YPR013C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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