RNA–Protein interactions for RNA: YOR014W

RTS1, Transcript of B-type regulatory subunit of protein phosphatase 2A (PP2A), yeast

Gene RTS1, Length 2,274 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTS1	YOR014W	PRM2	P40534	656 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	PXA1	P41909	870 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	BIT61	P47041	543 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	GCV2	P49095	1034 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	NCS6	P53088	359 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	YAP1802	P53309	568 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	REC102	Q02721	264 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	TLG1	Q03322	224 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	ARA2	Q04212	335 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	CBF2	P32504	956 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	CDS1	P38221	457 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	YGR130C	P53278	816 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	ORC3	P54790	616 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	SGO1	Q08490	590 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	HMG2	P12684	1045 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	MET8	P15807	274 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	COQ2	P32378	372 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	YBR259W	P38338	688 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	BCD1	P38772	366 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	YDL183C	P48569	320 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	CBK1	P53894	756 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	NSG2	P53898	299 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	PKH1	Q03407	766 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	RIT1	P23796	513 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	TAT1	P38085	619 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	NPR3	P38742	1146 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	ECM1	P39715	212 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	CHA4	P43634	648 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	SAP4	P53036	818 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	PPN1	Q04119	674 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	HOS1	Q12214	470 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	SWM1	Q12379	170 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	SEM1	O94742	89 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	QCR6	P00127	147 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	HIS5	P07172	385 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	CDC16	P09798	840 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	MRP7	P12687	371 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	BET2	P20133	325 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	VTC2	P43585	828 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	TAH11	P47112	604 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	SGM1	P47166	707 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	IMA1	P53051	589 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	CRD1	Q07560	283 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	MCA1	Q08601	432 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	CDC6	P09119	513 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	COX18	P53239	316 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	SPC19	Q03954	165 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	YKU80	Q04437	629 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	SNO4	Q04902	237 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	HSP32	Q08992	237 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	HMI1	Q12039	706 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	ECM3	Q99252	613 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	NUP120	P35729	1037 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	UBS1	P38290	277 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	GSM1	P42950	618 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	MRPS35	P53292	345 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	TIM10	P87108	93 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	ROT1	Q03691	256 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	PCD1	Q12524	340 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	KAE1	P36132	386 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	APT2	P36973	181 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
RTS1	YOR014W	GET2	P40056	285 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	POL31	P46957	487 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	BIK1	P11709	440 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RTS1	YOR014W	UME6	P39001	836 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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