RNA–Protein interactions for RNA: YOL083W

ATG34, Transcript of Receptor protein involved in selective autophagy during starvation, yeast

Gene ATG34, Length 1,239 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG34	YOL083W	YEL076C	P39971	216 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	FTR1	P40088	404 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	FDC1	Q03034	503 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	HLR1	Q04429	423 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	MPD2	Q99316	277 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	CTP1	P38152	299 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	KHA1	P40309	873 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	NDC80	P40460	691 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	HOL1	P53389	586 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	ATG4	P53867	494 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	TIM50	Q02776	476 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	NTH1	P32356	751 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	UBS1	P38290	277 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	ARG2	P40360	574 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	YJR008W	P47085	338 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	YDL183C	P48569	320 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	TMN2	Q04562	672 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	IZH3	Q07959	543 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	VPS5	Q92331	675 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	FUB1	P25659	250 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	TMN3	P40071	706 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	MNT2	P53059	558 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	PEF1	P53238	335 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	YGR151C	P53287	111 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	GND2	P53319	492 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	ABF1	P14164	731 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	EHT1	P38295	451 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	BDH2	P39713	417 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	STL1	P39932	569 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	SNF12	P53628	566 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	PSF3	Q12146	194 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	RKI1	Q12189	258 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	PHO3	P24031	467 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	NIC96	P34077	839 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	MTH1	P35198	433 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	YIL092W	P40497	633 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	UBA2	P52488	636 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	AIM41	Q12032	185 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	NUR1	Q12066	484 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	TAF3	Q12297	353 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	ELF1	P36053	145 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	YJL206C	P39529	758 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	MAD2	P40958	196 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	CTR1	P49573	406 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	KCC4	P25389	1037 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	CWH43	P25618	953 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	GLG1	P36143	616 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	MRPL7	P36519	292 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	NMA2	P53204	395 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	YNR071C	P53757	342 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	MET14	Q02196	202 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG34	YOL083W	URA3	P03962	267 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	ATP4	P05626	244 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	KIN3	P22209	435 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	ARG1	P22768	420 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	GMH1	P36125	273 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	LRO1	P40345	661 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	TAH11	P47112	604 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	DIP5	P53388	608 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	UFO1	Q04511	668 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	IRC10	Q08118	586 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	DIN7	Q12086	430 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	LAM4	P38800	1345 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	HOP1	P20050	605 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	APL3	P38065	1025 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	PPE1	P38796	400 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	SAW1	P39735	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	ARR3	Q06598	404 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	GAL1	P04385	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	TGL1	P34163	548 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	IMA5	P40884	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	PMT6	P42934	759 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	ASK10	P48361	1146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	MDR1	P53258	950 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG34	YOL083W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected

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