RNA–Protein interactions for RNA: YOL080C

REX4, Transcript of Putative RNA exonuclease, yeast

Gene REX4, Length 870 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REX4	YOL080C	CDS1	P38221	457 aa		5	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	YHR033W	P38690	423 aa		5	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
REX4	YOL080C	YEL020C	P39994	560 aa		5	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	MIT1	P40002	666 aa		5	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	ATF1	P40353	525 aa		5	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	SNF12	P53628	566 aa		5	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	STE12	P13574	688 aa		4.99	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	ATP12	P22135	325 aa		4.99	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	EUG1	P32474	517 aa		4.99	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	YMC2	P38087	329 aa		4.99	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	MUP3	P38734	546 aa		4.99	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	FTR1	P40088	404 aa		4.99	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	PRM2	P40534	656 aa		4.99	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	NSE5	Q03718	556 aa		4.99	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	PHO5	P00635	467 aa		4.98	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	PMT6	P42934	759 aa		4.98	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	UFO1	Q04511	668 aa		4.98	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	ARO10	Q06408	635 aa		4.98	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.98	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
REX4	YOL080C	RMP1	Q12530	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	QCR6	P00127	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
REX4	YOL080C	DGR2	P32330	852 aa		4.97	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	HXT4	P32467	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	MTC7	P32633	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	YJR120W	P47157	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	FDC1	Q03034	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	TMA17	Q12513	150 aa		4.97	□□□□□ -1.61
REX4	YOL080C	RPN13	O13563	156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	YPT53	P36019	220 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	EHT1	P38295	451 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	PPE1	P38796	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	SKY1	Q03656	742 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	TRS23	Q03784	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	NIT2	P47016	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	YML122C	Q03207	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	TRE2	Q08693	809 aa		4.95	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	STE4	P18851	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	AEP2	P22136	580 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	MRPL7	P36519	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	YDL183C	P48569	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	HLR1	Q04429	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.94	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	HMG2	P12684	1045 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	YBR071W	P38243	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	MFM1	Q02783	413 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	AIM41	Q12032	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	PAC2	P39937	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	SPC105	P53148	917 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	IMO32	P53219	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	TOP1	P04786	769 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	TPK2	P06245	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	PEA2	P40091	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	MRK1	P50873	501 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	YIP4	P53093	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	COG6	P53959	839 aa		4.91	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
REX4	YOL080C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	YMC1	P32331	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	YEL076C	P39971	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	EAF5	P39995	279 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	THI6	P41835	540 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	IRC5	P43610	853 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	TCB2	P48231	1178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
REX4	YOL080C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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