RNA–Protein interactions for RNA: YJL103C

GSM1, Transcript of Putative zinc cluster protein of unknown function, yeast

Gene GSM1, Length 1,857 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GSM1	YJL103C	FUS1	P11710	512 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	ENA1	P13587	1091 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	MRPS28	P21771	286 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	RDS1	P25611	832 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	MSH1	P25846	959 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	LOT5	P34234	306 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	SRL3	P36167	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	COS111	P38308	924 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	RIM4	P38741	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
GSM1	YJL103C	SKP2	P42843	763 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	VPS53	P47061	822 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	COG2	P53271	262 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	CWC24	P53769	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	SIW14	P53965	281 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	TGL2	P54857	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	GTR1	Q00582	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	YPL109C	Q02981	657 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	DML1	Q03652	475 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	NUP145	P49687	1317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	ADH4	P10127	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	SFL1	P20134	766 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	PTP2	P29461	750 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	SMI1	P32566	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	PMT1	P33775	817 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	PHO11	P35842	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	NUP133	P36161	1157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	UBS1	P38290	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	YMR262W	P38430	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	PHO12	P38693	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	CEM1	P39525	442 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	YIL092W	P40497	633 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	CNN1	P43618	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	POL31	P46957	487 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	HLJ1	P48353	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	LYS5	P50113	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	NUT1	P53114	1132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	YGR122W	P53272	402 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	MRS2	Q01926	470 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	EAR1	Q03212	550 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	PDR8	Q06149	701 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	DCS1	Q06151	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	OXR1	Q08952	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
GSM1	YJL103C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	YPK2	P18961	677 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	CDC15	P27636	974 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	UGA4	P32837	571 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	SLA2	P33338	968 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	SEG2	P34250	1132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	STL1	P39932	569 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	BUD16	P39988	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	KHA1	P40309	873 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	YRB2	P40517	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	SYG1	P40528	902 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	PMT3	P47190	753 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	TOF1	P53840	1238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	YMR102C	Q03177	834 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	ARP10	Q04549	284 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	DAL4	Q04895	635 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	ESC2	Q06340	456 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	SFI1	Q12369	946 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	TRP3	P00937	484 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	PET122	P10355	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	SEC63	P14906	663 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	CYC8	P14922	966 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	DBF20	P32328	564 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	TFA2	P36145	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	SEA4	P38164	1038 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	MTG2	P38860	518 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GSM1	YJL103C	MAD3	P47074	515 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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