RNA–Protein interactions for RNA: YBR267W

REI1, Transcript of Cytoplasmic pre-60S factor, yeast

Gene REI1, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REI1	YBR267W	CTM1	P38818	585 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	RAD55	P38953	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	NUP85	P46673	744 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SAM37	P50110	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	MTO1	P53070	669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	CDC55	Q00362	526 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	ADY4	Q05955	493 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	SHS1	Q07657	551 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	ATG9	Q12142	997 aa		4.84	□□□□□ -1.63
REI1	YBR267W	PHO8	P11491	566 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	DAL1	P32375	460 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	PET10	P36139	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	PXL1	P36166	706 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	SFB3	P38810	929 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	NPP2	P39997	493 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	STB4	P50104	949 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	ORC5	P50874	479 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	GUP1	P53154	560 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	TOF1	P53840	1238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	VPS60	Q03390	229 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	YHM2	Q04013	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	VPS38	Q05919	439 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	COG4	Q06096	861 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	FMP25	Q08023	583 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	STB3	Q12427	513 aa		4.83	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	MSN1	P22148	382 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	SPO11	P23179	398 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	RPC25	P35718	212 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	TCD1	P38756	429 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	ERC1	P38767	581 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	CAJ1	P39101	391 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	IES1	P43579	692 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	VTC4	P47075	721 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	YJR098C	P47139	656 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	BSC2	Q05611	235 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	FLC1	Q08967	793 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.82	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	MSB2	P32334	1306 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	TPK1	P06244	397 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	PET111	P08468	800 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	OM45	P16547	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	GPI10	P30777	616 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	LTV1	P34078	463 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	DUG2	P38149	878 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	GIP1	P38229	639 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	EFM2	P38347	419 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	FAA3	P39002	694 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	FTR1	P40088	404 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	NTA1	P40354	457 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	SEC9	P40357	651 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	DAS1	P47005	663 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	YNR061C	P53747	219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	ALF1	P53904	254 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	RSC4	Q02206	625 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	YAP7	Q08182	245 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	HMI1	Q12039	706 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	IRA2	P19158	3079 aa		4.81	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	STE11	P23561	717 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	GAC1	P28006	793 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	PSY2	P40164	858 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	RGD2	P43556	714 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	SMC3	P47037	1230 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	ZAP1	P47043	880 aa		4.8	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.6 ms