RNA–Protein interactions for RNA: YBR194W

AIM4, Transcript of Protein proposed to be associated with the nuclear pore complex, yeast

Gene AIM4, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM4	YBR194W	YMC2	P38087	329 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	CTP1	P38152	299 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	RIM4	P38741	713 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	MIT1	P40002	666 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	KHA1	P40309	873 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	MPS3	P47069	682 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	YGR153W	P48238	217 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	RFX1	P48743	811 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	MRK1	P50873	501 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	PIP2	P52960	996 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	YGR021W	P53212	290 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	MET14	Q02196	202 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	YFT2	Q06676	274 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	VHS3	Q08438	674 aa		3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	SWI6	P09959	803 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	PTP2	P29461	750 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	YKU70	P32807	602 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	NIC96	P34077	839 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	YKL133C	P36066	463 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	TDA3	P38758	523 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	IES5	P40060	125 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	YIL077C	P40508	320 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	PHM6	Q05637	104 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	MLC2	Q06580	163 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	YDL086W	Q07505	273 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	APM4	Q99186	491 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	MPD2	Q99316	277 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	PIF1	P07271	859 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	COS111	P38308	924 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	MUP3	P38734	546 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	SLD3	P53135	668 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	SNF12	P53628	566 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	ECM9	Q02202	377 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	SKY1	Q03656	742 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	YLR407W	Q06070	228 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	YPS7	Q06325	596 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	PSR2	Q07949	397 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	IZH3	Q07959	543 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	PEX15	Q08215	383 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	PHO5	P00635	467 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	ABF1	P14164	731 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	SPO11	P23179	398 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	KIN82	P25341	720 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	KCC4	P25389	1037 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	HXT7	P39004	570 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	BUD8	P41698	603 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	SPC105	P53148	917 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	GAL1	P04385	528 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	THI7	Q05998	598 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	STP4	Q07351	490 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	HFI1	Q12060	488 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	YPR027C	Q12079	277 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	RKI1	Q12189	258 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	LAM4	P38800	1345 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	OAF3	P36023	863 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	IES1	P43579	692 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	BFA1	P47113	574 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	NMA2	P53204	395 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	YMR210W	Q03649	449 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	YHM2	Q04013	314 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
AIM4	YBR194W	MDM10	P18409	493 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AIM4	YBR194W	VPS34	P22543	875 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AIM4	YBR194W	YKR075C	P36155	307 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AIM4	YBR194W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
AIM4	YBR194W	HOL1	P53389	586 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AIM4	YBR194W	OSW1	Q08692	278 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AIM4	YBR194W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AIM4	YBR194W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AIM4	YBR194W	PHO81	P17442	1178 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AIM4	YBR194W	STE4	P18851	423 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AIM4	YBR194W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AIM4	YBR194W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AIM4	YBR194W	PRE4	P30657	266 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AIM4	YBR194W	NTH1	P32356	751 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AIM4	YBR194W	APL3	P38065	1025 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AIM4	YBR194W	CDS1	P38221	457 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AIM4	YBR194W	SAP185	P40856	1058 aa		3.51	□□□□□ -1.85

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