RNA–Protein interactions for RNA: Q0065

AI4, Transcript of Endonuclease I-SceII, yeast

Gene AI4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI4	Q0065	SDS22	P36047	338 aa		4.14	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	RIM4	P38741	713 aa		4.14	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	PIG2	P40187	538 aa		4.14	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	IRC5	P43610	853 aa		4.14	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	MLC2	Q06580	163 aa		4.14	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	HOP1	P20050	605 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	IME1	P21190	360 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	PRP28	P23394	588 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	TAF5	P38129	798 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	STL1	P39932	569 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	BUD8	P41698	603 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	UBC11	P52492	156 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	PIP2	P52960	996 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	MTL1	P53214	551 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	SEC5	P89102	971 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	MET14	Q02196	202 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	ATP12	P22135	325 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	KCC4	P25389	1037 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	DMC1	P25453	334 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	LYS9	P38999	446 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	FMP52	P40008	231 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	GET2	P40056	285 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	GLO1	P50107	326 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	HLR1	Q04429	423 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	THI22	Q06490	572 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	VPS36	Q06696	566 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	IRC13	Q08630	104 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	VPS5	Q92331	675 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	GAL1	P04385	528 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	TOP1	P04786	769 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	SIR3	P06701	978 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	HXT4	P32467	576 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	BCD1	P38772	366 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	FMO1	P38866	432 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	SAW1	P39735	261 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	PSF3	Q12146	194 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	ECM3	Q99252	613 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	CWH43	P25618	953 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	DPB3	P27344	201 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	NTH1	P32356	751 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	YHR033W	P38690	423 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	YEL076C	P39971	216 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	YNL195C	P40168	261 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	PEF1	P53238	335 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	TRI1	Q05024	226 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	AIM41	Q12032	185 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	ZRT2	Q12436	422 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	PRE4	P30657	266 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	YIL092W	P40497	633 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	PRM2	P40534	656 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	ASK10	P48361	1146 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	UBX4	P54730	416 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	SSL2	Q00578	843 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	FDC1	Q03034	503 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	ABF1	P14164	731 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	BCS1	P32839	456 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	PTH2	P34222	208 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	COS111	P38308	924 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	TEL2	P53038	688 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	YFT2	Q06676	274 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AI4	Q0065	PHO3	P24031	467 aa		4.09	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	TAF3	Q12297	353 aa		4.09	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	ARP7	Q12406	477 aa		4.09	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	TGL1	P34163	548 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	YLF2	P38746	405 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	YIL077C	P40508	320 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	HIS6	P40545	261 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	HOS1	Q12214	470 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	HMG2	P12684	1045 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	SPO11	P23179	398 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	SFB3	P38810	929 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	YJL206C	P39529	758 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	EAF5	P39995	279 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	FHN1	P53279	174 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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