RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466490.6

SRPRB-201, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SRPRB, Length 2,827 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-201ENST00000466490 PROSER3Q2NL68 480 aa15.5■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 CERS3Q8IU89 383 aa15.5■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.5■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 C8orf76Q96K31 380 aa15.5■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 HAUS7Q99871 368 aa15.5■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 PPFIA3O75145 1194 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 TUBB4BP68371 445 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 TNNI3KQ59H18 835 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 ANO1Q5XXA6 986 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 FBXL16Q8N461 479 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 PDE11AQ9HCR9 933 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 RAB21Q9UL25 225 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 E7EWF7 191 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 CHGBP05060 677 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 SYKP43405 635 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 CHMP4BP1P59074 171 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 OLFM4Q6UX06 510 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 BRMS1Q9HCU9 246 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 FANCLQ9NW38 375 aa15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 ERLIN1O75477 346 aa15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 TC2NQ8N9U0 490 aa15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 COPRSQ9NQ92 184 aa15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 HELLSQ9NRZ9 838 aa15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 INTS13Q9NVM9 706 aa15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 CUTAO60888 179 aa15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 MLECQ14165 292 aa15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 MCM6Q14566 821 aa15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 CEP112Q8N8E3 955 aa15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 KBTBD3Q8NAB2 608 aa15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 MSANTD4Q8NCY6 345 aa15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 C19orf44Q9H6X5 657 aa15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa15.48■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa15.47■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 SLC39A14Q15043 492 aa15.47■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 HPSEQ9Y251 543 aa15.47■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 LMO7Q8WWI1 1683 aa15.47■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 TUBB2AQ13885 445 aa15.47■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 PDILTQ8N807 584 aa15.47■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 SLC26A8Q96RN1 970 aa15.47■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 TUBB2BQ9BVA1 445 aa15.47■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 L1RE1Q9UN81 338 aa15.47■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa15.46■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 PALLDQ8WX93 1383 aa15.46■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 HEG1Q9ULI3 1381 aa15.46■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.46■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 TICAM2Q86XR7 235 aa15.46■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 RGS22Q8NE09 1264 aa15.46■□□□□ 0.07
SRPRB-201ENST00000466490 USP54Q70EL1 1684 aa15.46■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa15.45■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 IGKV5-2P06315 115 aa15.45■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 TFCP2Q12800 502 aa15.45■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 PTPN21Q16825 1174 aa15.45■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.45■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ANKRD24Q8TF21 1146 aa15.45■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 CDC23Q9UJX2 597 aa15.45■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 PNOCQ13519 176 aa15.45■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 FAN1Q9Y2M0 1017 aa15.45■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 JRKLQ9Y4A0 524 aa15.45■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 PPP6R2O75170 966 aa15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 CCDC175P0C221 793 aa15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ADKP55263 362 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 KARSQ15046 597 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 CHST3Q7LGC8 479 aa15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 PACS2Q86VP3 889 aa15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 JMYQ8N9B5 988 aa15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 FAM71BQ8TC56 605 aa15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 PPM1EQ8WY54 764 aa15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 DBNDD2Q9BQY9 259 aa15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 KIF28PB7ZC32 967 aa15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 TMEM2Q9UHN6 1383 aa15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 GUCY2CP25092 1073 aa15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 CORO7P57737 925 aa15.44■□□□□ 0.06
SRPRB-201ENST00000466490 EPHA10Q5JZY3 1008 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.9 ms