RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 CBX8Q9HC52 389 aa22.51■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 CPLX1O14810 134 aa22.5■■□□□ 1.19
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USP21-201ENST00000289865 C8orf76Q96K31 380 aa22.5■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.5■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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USP21-201ENST00000289865 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.5■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 C4AP0C0L4 1744 aa22.5■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 C4BP0C0L5 1744 aa22.5■■□□□ 1.19
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USP21-201ENST00000289865 PARP10Q53GL7 1025 aa22.49■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 DOCK2Q92608 1830 aa22.49■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.49■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
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USP21-201ENST00000289865 TPM2P07951 284 aa22.48■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 MAP3K12Q12852 859 aa22.48■■□□□ 1.19
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USP21-201ENST00000289865 B4E1Z4 1266 aa22.47■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 NTSR2O95665 410 aa22.47■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
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USP21-201ENST00000289865 SPC24Q8NBT2 197 aa22.46■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 NEDD4P46934 1319 aa22.46■■□□□ 1.19
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USP21-201ENST00000289865 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
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USP21-201ENST00000289865 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
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USP21-201ENST00000289865 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.46■■□□□ 1.19
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USP21-201ENST00000289865 LAMB2P55268 1798 aa22.46■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 CHD4Q14839 1912 aa22.45■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
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USP21-201ENST00000289865 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.45■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.45■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 ZNF165P49910 485 aa22.45■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
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USP21-201ENST00000289865 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.41■■□□□ 1.18
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USP21-201ENST00000289865 CDC27P30260 824 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 STX1AQ16623 288 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 ADALQ6DHV7 355 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.4■■□□□ 1.18
USP21-201ENST00000289865 COL4A1P02462 1669 aa22.4■■□□□ 1.18
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