RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 CNKSR1Q969H4 720 aa15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 ARMT1Q9H993 441 aa15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP15.67■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 SIK1P57059 783 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 USP48Q86UV5 1035 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 PKD2L1Q9P0L9 805 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 PAFAH1B1P43034 410 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 GSDMDP57764 484 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 GTF2IP78347 998 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 HOOK3Q86VS8 718 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 RXRAP19793 462 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 TNFAIP1Q13829 316 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 RRAGBQ5VZM2 374 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 CTR9Q6PD62 1173 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 FAM212AQ96EL1 285 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 TMX1Q9H3N1 280 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 KIAA0232Q92628 1395 aa15.66■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 SPECC1Q5M775 1068 aa15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 FAM13AO94988 1023 aa15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 STX1AQ16623 288 aa15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 CSADQ9Y600 493 aa15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 N4BP3O15049 544 aa15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 PRDM1O75626 825 aa15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 APOBRQ0VD83 1088 aa15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 FAM182BQ5T319 152 aa15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 RAD50Q92878 1312 aa15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 CREB3L3Q68CJ9 461 aa15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 HS2ST1Q7LGA3 356 aa15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 CPXCR1Q8N123 301 aa15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 HELLSQ9NRZ9 838 aa15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 MROH5Q6ZUA9 1318 aa15.65■□□□□ 0.1
USP22-201ENST00000261497 CCDC172P0C7W6 258 aa15.64■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 KRT2P35908 639 aa15.64■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 TMCO5BA8MYB1 307 aa15.64■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 NOP2P46087 812 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 USP19O94966 1318 aa15.64■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 RLBP1P12271 317 aa15.64■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 TAF12Q16514 161 aa15.64■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.64■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa15.64■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 SLC1A4P43007 532 aa15.64■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 CEP135Q66GS9 1140 aa15.64■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 APPBP2Q92624 585 aa15.64■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 FERMT1Q9BQL6 677 aa15.64■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 SUCLG2Q96I99 432 aa15.63■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 PSMA7O14818 248 aa15.63■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.63■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 COMMD10Q9Y6G5 202 aa15.63■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 KLHL40Q2TBA0 621 aa15.63■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa15.63■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa15.63■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 PZPP20742 1482 aa15.63■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 ZNF165P49910 485 aa15.63■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 USPL1Q5W0Q7 1092 aa15.63■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 NSMFQ6X4W1 530 aa15.63■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 TEKT1Q969V4 418 aa15.63■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 B4E1Z4 1266 aa15.62■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 TMC6Q7Z403 805 aa15.62■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 MCM7P33993 719 aa15.62■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 TBC1D5Q92609 795 aa15.62■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 GINS2Q9Y248 185 aa15.62■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 ZBED4O75132 1171 aa15.62■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 AKR1B10O60218 316 aa15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 ACTN2P35609 894 aa15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 UBE2HP62256 183 aa15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 UVSSAQ2YD98 709 aa15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 SULF1Q8IWU6 871 aa15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 GPAA1O43292 621 aa15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 ZNF354CQ86Y25 554 aa15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 DHX58Q96C10 678 aa15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 GOPCQ9HD26 462 aa15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 PTPDC1A2A3K4 754 aa15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 SPATA5Q8NB90 893 aa15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 MYZAPP0CAP1 466 aa15.61■□□□□ 0.09
USP22-201ENST00000261497 DTHD1Q6ZMT9 781 aa15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms