RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000211953.1

Lncbate1-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lncbate1, Length 812 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Casp12O08736 419 aa8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Celf1P28659 486 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Syt1P46096 421 aa8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cyp2c40P56657 491 aa8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 PcQ05920 1178 aa8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Esyt2Q3TZZ7 845 aa8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pcsk7Q61139 770 aa8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Zcwpw1Q6IR42 630 aa8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ncaph2Q8BSP2 607 aa8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 IarsQ8BU30 1262 aa8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Stac3Q8BZ71 360 aa8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gpr108Q91WD0 569 aa8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rufy3Q9D394 469 aa8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rcan1Q9JHG6 198 aa8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pus3Q9JI38 481 aa8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Myh13B1AR69 1938 aa8.41□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Aox3G3X982 1335 aa8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Wdr19Q3UGF1 1341 aa8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Irgm2A0A140LIF8 407 aa8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm45015A0A140LII9 184 aa8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm18336A0A140LIU8 765 aa8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cfap70D3YVL2 1141 aa8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ppef1O35655 650 aa8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pald1P70261 859 aa8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gas1Q01721 343 aa8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rnf180Q3U827 592 aa8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cep63Q3UPP8 700 aa8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tango6Q8C3S2 1079 aa8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Q8C6G1 249 aa8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cdca7lQ922M5 438 aa8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 MthfsQ9D110 203 aa8.4□□□□□ -1.06
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 EvplQ9D952 2035 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pnpla6Q3TRM4 1355 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Aox1O54754 1333 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Eef2kO08796 724 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Adam7O35227 789 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Prl7a2O54831 253 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Znf326O88291 580 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cyp2d9P11714 504 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ddit3P35639 168 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm21985Q6P6P5 1106 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Atp2b4Q6Q477 1205 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Znf516Q7TSH3 1157 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ppp1r10Q80W00 888 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 HlfQ8BW74 295 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 BrapQ99MP8 591 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 CpvlQ9D3S9 478 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Megf6Q80V70 1572 aa8.39□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Siah1aP61092 282 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cnnm2Q3TWN3 875 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gpr162Q3UN16 588 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pla2g4fQ50L41 855 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Sept9Q80UG5 583 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tmem67Q8BR76 992 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Lmbrd2Q8C561 694 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Slc14a2Q8R4T9 930 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 FktnQ8R507 461 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Trmt44Q9D2Q2 713 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cyp2ab1S4R196 498 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Chd5A2A8L1 1946 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Col5a2Q3U962 1497 aa8.38□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Zfp831A2ADM8 1628 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dock5B2RY04 1868 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 E9Q0B3 247 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Casp1P29452 402 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Stat1P42225 749 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 NfixP70257 488 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ppp4cP97470 307 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Washc4Q3UMB9 1173 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ccdc51Q3URS9 406 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nell2Q61220 819 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 B4galnt4Q766D5 1034 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 VmacQ8BP01 174 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Paf1Q8K2T8 535 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Krt84Q99M73 603 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fam84aQ9D650 292 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Psme4Q5SSW2 1843 aa8.37□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Med23Q80YQ2 1367 aa8.36□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 TrdnE9Q9K5 693 aa8.36□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 ArxO35085 564 aa8.36□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 CrcpO35427 148 aa8.36□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 FanccP50652 591 aa8.36□□□□□ -1.07
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Zdhhc9P59268 364 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.2 ms