RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000124246.3

Gt(ROSA)26Sor-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gt(ROSA)26Sor, Length 1,181 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Uba5Q8VE47 403 aa26.21■■□□□ 1.79
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sp8Q8BMJ8 486 aa26.2■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Il21rQ9JHX3 529 aa26.2■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccne2Q9Z238 404 aa26.2■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ier5O89113 308 aa26.19■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 AsnsQ61024 561 aa26.19■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Btbd19S4R1I0 287 aa26.19■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa26.18■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ets1P27577 440 aa26.18■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fdx1P46656 188 aa26.18■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Timm10P62073 90 aa26.18■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Spata21Q8BHW6 681 aa26.18■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 H2-Q4Q8HWB2 354 aa26.18■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Myh3P13541 1940 aa26.18■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ly6dP35459 127 aa26.17■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lins1Q3U1D0 764 aa26.17■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa26.17■■□□□ 1.78
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Txnrd3Q99MD6 652 aa26.17■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Adam7O35227 789 aa26.16■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Prkar2bP31324 416 aa26.16■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Clul1Q3ZRW6 464 aa26.16■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pram1Q6BCL1 675 aa26.16■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ankrd13aQ80UP5 588 aa26.16■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Phf20Q8BLG0 1010 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nudt12Q9DCN1 462 aa26.15■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nphp3Q7TNH6 1325 aa26.14■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gsdma2Q32M21 443 aa26.14■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cwc27Q3TKY6 469 aa26.14■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tigd5Q499M4 642 aa26.14■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cnksr2Q80YA9 1032 aa26.14■■□□□ 1.78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lrrc24Q8BHA1 521 aa26.13■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Txnrd2Q9JLT4 524 aa26.13■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Aox4Q3TYQ9 1336 aa26.13■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa26.12■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Neurod6P48986 337 aa26.12■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Grm1P97772 1199 aa26.12■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa26.12■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Otud5Q3U2S4 566 aa26.12■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lamc2Q61092 1191 aa26.12■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 C8aQ8K182 587 aa26.12■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa26.12■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gprin1Q3UNH4 932 aa26.11■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lca5lQ8C0X0 741 aa26.11■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ero1bQ8R2E9 467 aa26.11■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 TsksO54887 585 aa26.1■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mmp20P57748 482 aa26.1■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa26.1■■□□□ 1.77
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fam84aQ9D650 292 aa26.1■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ralgps2Q9ERD6 590 aa26.1■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa26.1■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tuft1O08970 390 aa26.09■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Slc7a3P70423 618 aa26.09■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fam102bQ8BQS4 339 aa26.09■■□□□ 1.77
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Hps4Q99KG7 671 aa26.09■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Apbb1Q9QXJ1 710 aa26.09■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm42715A0A087WP63 3095 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Plcg1Q62077 1302 aa26.09■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa26.09■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Flvcr1B2RXV4 560 aa26.08■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sox10Q04888 466 aa26.08■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ppp1r26Q6A025 1163 aa26.08■■□□□ 1.77
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zgrf1Q0VGT4 1863 aa26.07■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nek9Q8K1R7 984 aa26.07■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 MyocdQ8VIM5 935 aa26.07■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Specc1Q5SXY1 1067 aa26.06■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tmc4Q7TQ65 694 aa26.06■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tut1Q8R3F9 869 aa26.06■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Htra3Q9D236 459 aa26.06■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 MvpQ9EQK5 861 aa26.06■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mmp10O55123 476 aa26.05■■□□□ 1.76
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Stat5bP42232 786 aa26.05■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nlrp9aQ66X03 949 aa26.05■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mbtps2Q8CHX6 515 aa26.05■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ubxn11Q9D572 484 aa26.05■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Atp8b2P98199 1209 aa26.04■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Aldh1l2Q8K009 923 aa26.04■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 XdhQ00519 1335 aa26.04■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tsc2Q61037 1814 aa26.03■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cfap99A0A140LIX9 648 aa26.03■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Grem2O88273 168 aa26.03■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Bace1P56818 501 aa26.03■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ppm1jQ149T7 507 aa26.03■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abtb2Q7TQI7 1024 aa26.03■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 PpatQ8CIH9 517 aa26.03■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Syne4Q8CII8 388 aa26.03■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Vmn1r199Q8R280 367 aa26.03■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cntnap3E9PY62 1287 aa26.02■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Hap1O35668 628 aa26.02■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Slc4a1P04919 929 aa26.02■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ube3cQ80U95 1083 aa26.02■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa26.02■■□□□ 1.76
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