Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.57■■■■■ 4.89
Specc1Q5SXY1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Specc1Q5SXY1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Specc1Q5SXY1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
Specc1Q5SXY1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
Specc1Q5SXY1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Specc1Q5SXY1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Specc1Q5SXY1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Specc1Q5SXY1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Specc1Q5SXY1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Specc1Q5SXY1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Specc1Q5SXY1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Specc1Q5SXY1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Specc1Q5SXY1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Specc1Q5SXY1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Specc1Q5SXY1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Specc1Q5SXY1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Specc1Q5SXY1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
Specc1Q5SXY1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Specc1Q5SXY1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Specc1Q5SXY1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Specc1Q5SXY1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Specc1Q5SXY1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Specc1Q5SXY1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Specc1Q5SXY1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Specc1Q5SXY1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Specc1Q5SXY1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Specc1Q5SXY1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Specc1Q5SXY1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Specc1Q5SXY1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Specc1Q5SXY1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Specc1Q5SXY1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Specc1Q5SXY1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Specc1Q5SXY1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Specc1Q5SXY1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Specc1Q5SXY1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Specc1Q5SXY1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Specc1Q5SXY1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Specc1Q5SXY1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Specc1Q5SXY1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Specc1Q5SXY1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Specc1Q5SXY1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Specc1Q5SXY1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Specc1Q5SXY1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Specc1Q5SXY1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Specc1Q5SXY1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Specc1Q5SXY1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Specc1Q5SXY1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Specc1Q5SXY1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Specc1Q5SXY1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Specc1Q5SXY1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Specc1Q5SXY1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Specc1Q5SXY1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Specc1Q5SXY1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Specc1Q5SXY1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Specc1Q5SXY1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Specc1Q5SXY1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Specc1Q5SXY1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Specc1Q5SXY1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Specc1Q5SXY1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Specc1Q5SXY1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Specc1Q5SXY1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Specc1Q5SXY1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Specc1Q5SXY1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Specc1Q5SXY1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Specc1Q5SXY1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Specc1Q5SXY1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Specc1Q5SXY1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Specc1Q5SXY1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Specc1Q5SXY1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Specc1Q5SXY1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Specc1Q5SXY1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Specc1Q5SXY1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Specc1Q5SXY1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Specc1Q5SXY1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Specc1Q5SXY1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Specc1Q5SXY1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Specc1Q5SXY1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Specc1Q5SXY1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Specc1Q5SXY1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Specc1Q5SXY1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Specc1Q5SXY1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Specc1Q5SXY1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Specc1Q5SXY1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Specc1Q5SXY1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Specc1Q5SXY1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Specc1Q5SXY1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Specc1Q5SXY1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Specc1Q5SXY1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Specc1Q5SXY1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Specc1Q5SXY1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Specc1Q5SXY1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Specc1Q5SXY1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Specc1Q5SXY1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Specc1Q5SXY1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Specc1Q5SXY1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Specc1Q5SXY1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Specc1Q5SXY1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Specc1Q5SXY1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Specc1Q5SXY1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms