RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394285.3

PDCL-202, Transcript of phosducin like, humanhuman

TSL 3

Gene PDCL, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-202ENST00000394285 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.72□□□□□ -1.01
PDCL-202ENST00000394285 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.72□□□□□ -1.01
PDCL-202ENST00000394285 DTYMKP23919 212 aa8.72□□□□□ -1.01
PDCL-202ENST00000394285 TALDO1P37837 337 aa8.72□□□□□ -1.01
PDCL-202ENST00000394285 ARFRP1Q13795 201 aa8.72□□□□□ -1.01
PDCL-202ENST00000394285 HACD4Q5VWC8 232 aa8.72□□□□□ -1.01
PDCL-202ENST00000394285 COMMD1Q8N668 190 aa8.72□□□□□ -1.01
PDCL-202ENST00000394285 Q8N9W7 124 aa8.72□□□□□ -1.01
PDCL-202ENST00000394285 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PDCL-202ENST00000394285 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.72□□□□□ -1.01
PDCL-202ENST00000394285 RNF5Q99942 180 aa8.72□□□□□ -1.01
PDCL-202ENST00000394285 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PDCL-202ENST00000394285 ZNF580Q9UK33 172 aa8.72□□□□□ -1.01
PDCL-202ENST00000394285 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 A0A0B4J203 849 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 AIREO43918 545 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 PROP1O75360 226 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 CTXN2P0C2S0 81 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 CD28P10747 220 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 GNB3P16520 340 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 MXD1Q05195 221 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 FOXRED2Q8IWF2 684 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 PHF21AQ96BD5 680 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 GON7Q9BXV9 100 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 ZNF221Q9UK13 617 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 SPATA2Q9UM82 520 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 SMIM30A4D0T7 59 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 OR5H14A6NHG9 310 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 AP4M1O00189 453 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 ST8SIA5O15466 376 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 KCNAB3O43448 404 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 RBBP9O75884 186 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 TSPAN15O95858 294 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 CLEC2LP0C7M8 214 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 CT45A6P0DMU7 189 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 CT45A5P0DMU8 189 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 CT45A7P0DMV0 189 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 OR3A3P47888 321 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 ZNF260Q3ZCT1 412 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 NPBQ8NG41 125 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 OR4F4Q96R69 305 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 RNF167Q9H6Y7 350 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 DIABLOQ9NR28 239 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 ZFP57Q9NU63 452 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 RDH8Q9NYR8 311 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 PSMB11A5LHX3 300 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 NDUFA3O95167 84 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 IGF1P05019 195 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 GSTT2P0CG29 244 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 GSTT2BP0CG30 244 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 SLC6A1P30531 599 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 SOX6P35712 828 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 RPS19P39019 145 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 GPR12P47775 334 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 F2RL1P55085 397 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 ACTBP60709 375 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 SLC35B1P78383 322 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 IGSF11Q5DX21 431 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 IDNKQ5T6J7 187 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 ABHD14BQ96IU4 210 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 A0A075B6Q4 140 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 BET1O15155 118 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 HLA-DRB1P01911 266 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 MMDQ15546 238 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 LIN54Q6MZP7 749 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 CNIH2Q6PI25 160 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 STPG2Q8N412 459 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 OR13F1Q8NGS4 319 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCL-202ENST00000394285 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms