RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPARTQ8N0X7 666 aa13.57□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 LYG1Q8N1E2 194 aa13.57□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR2AK2Q8NG84 335 aa13.57□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR52L2PQ8NGH6 319 aa13.57□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHPT1Q8WUD6 406 aa13.57□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 C12orf4Q9NQ89 552 aa13.57□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB22AQ9UL26 194 aa13.57□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa13.56□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFITM5A6NNB3 132 aa13.56□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa13.56□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGHG2P01859 326 aa13.56□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM71F2Q6NXP2 309 aa13.56□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 R3HDM4Q96D70 268 aa13.56□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 GHITMQ9H3K2 345 aa13.56□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 AK3Q9UIJ7 227 aa13.56□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB3BP20337 219 aa13.55□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSMB9P28065 219 aa13.55□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 VEGFCP49767 419 aa13.55□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLDN12P56749 244 aa13.55□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 LSAMPQ13449 338 aa13.55□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 HES5Q5TA89 166 aa13.55□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC35E3Q7Z769 313 aa13.55□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOXRED2Q8IWF2 684 aa13.55□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL1F10Q8WWZ1 152 aa13.55□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYYR1Q96J86 154 aa13.55□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCG5Q9H222 651 aa13.55□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSMB11A5LHX3 300 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 SERPINE3A8MV23 424 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ITGB1BP1O14713 200 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB6AP20340 208 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM50BP56557 158 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 HLA-DRB3P79483 266 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF773Q6PK81 442 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ODF3L1Q8IXM7 274 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 COMMD1Q8N668 190 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 SETD6Q8TBK2 473 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTX4Q96A99 478 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 GON7Q9BXV9 100 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PECRQ9BY49 303 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIPOXQ9P0Z9 390 aa13.54□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 AP4M1O00189 453 aa13.53□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBTB25P24278 435 aa13.53□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 GADD45AP24522 165 aa13.53□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC35B1P78383 322 aa13.53□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 C22orf42Q6IC83 251 aa13.53□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q6ZPA2 131 aa13.53□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q8N9W7 124 aa13.53□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 EDARADDQ8WWZ3 215 aa13.53□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB3CQ96E17 227 aa13.53□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 S1PR3Q99500 378 aa13.53□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 RASL11BQ9BPW5 248 aa13.53□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q9N2K0 584 aa13.53□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLSCR3Q9NRY6 295 aa13.53□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC23A1Q9UHI7 598 aa13.53□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 STUB1Q9UNE7 303 aa13.53□□□□□ -0.24
CCNDBP1-211ENST00000567434 SHISA3A0PJX4 238 aa13.52□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 METTL21EPA6NDL7 271 aa13.52□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB29O14966 203 aa13.52□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR10A3P58181 314 aa13.52□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCTD21Q4G0X4 260 aa13.52□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLAC9Q5JTB6 97 aa13.52□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 TPRA1Q86W33 373 aa13.52□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa13.52□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 NABP2Q9BQ15 211 aa13.52□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFI27L2Q9H2X8 130 aa13.52□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 SSR3Q9UNL2 185 aa13.52□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa13.51□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSPA12AO43301 675 aa13.51□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD3GP09693 182 aa13.51□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 PF4V1P10720 104 aa13.51□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC6A1P30531 599 aa13.51□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPR12P47775 334 aa13.51□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARL6IP1Q15041 203 aa13.51□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 C5orf24Q7Z6I8 188 aa13.51□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 STPG2Q8N412 459 aa13.51□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR10R2Q8NGX6 335 aa13.51□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 CENPOQ9BU64 300 aa13.51□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF580Q9UK33 172 aa13.51□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1W2PRX2 142 aa13.5□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 NOTOA8MTQ0 251 aa13.5□□□□□ -0.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRDCB7Z8K6 153 aa13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms