RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484483.1

PTP4A2-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2, human

TSL 2

Gene PTP4A2, Length 651 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	LEUTX	A8MZ59	168 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483		J3QR06	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	IGLV1-47	P01700	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	CRYBA1	P05813	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	HKR1	P10072	659 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	PAX6	P26367	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	RAB13	P51153	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	EFNB2	P52799	333 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	LOXL3	P58215	753 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	MXD1	Q05195	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	PECR	Q9BY49	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483		H3BUX3	64 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	RAB27B	O00194	218 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	SPINT2	O43291	252 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	GPR137B	O60478	399 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	NAPSA	O96009	420 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	HBZ	P02008	142 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	TFAP2A	P05549	437 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	ELANE	P08246	267 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	GCSH	P23434	173 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	TGFBR1	P36897	503 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	ACTG1	P63261	375 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	HTD2	P86397	168 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	IDNK	Q5T6J7	187 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	MMP28	Q9H239	520 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	AK3	Q9UIJ7	227 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-205	ENST00000484483	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTP4A2-205	ENST00000484483		A0A1W2PPE3	182 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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