RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 SLC25A28Q96A46 364 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 RNFT2Q96EX2 444 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 OPN4Q9UHM6 478 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 FAM74A7A6NL05 159 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 IGHV2-70P01814 119 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 FABP1P07148 127 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 SMIM6P0DI80 62 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 RELBQ01201 579 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 Q3ZCU0 254 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 FUZQ9BT04 418 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 ABCG5Q9H222 651 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 TMEM82A0PJX8 343 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 LGALS8O00214 317 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 MMP23AO75900 390 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 TCRBP04435 133 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 TACSTD2P09758 323 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 TSPAN5P62079 268 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 DRAM2Q6UX65 266 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 MRAPQ8TCY5 172 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 BORCS8Q96FH0 119 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 OR10A4Q9H209 315 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 BANF2Q9H503 90 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 NUDT15Q9NV35 164 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-212ENST00000548567 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 L7N2F9 121 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 TTRP02766 147 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 PSG2P11465 335 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 SAA4P35542 130 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 OR3A4PP47883 348 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 UBE2V2Q15819 145 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 OCLNQ16625 522 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 C12orf73Q69YU5 71 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 MKXQ8IYA7 352 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ST8SIA5O15466 376 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 HTR3BO95264 441 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 KNG1P01042 644 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 APOC3P02656 99 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ZNF20P17024 532 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 SERPINA2P20848 420 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 GABRA5P31644 462 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 GLP1RP43220 463 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 HMGA2P52926 109 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 BLCAPP62952 87 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 OR52N1Q8NH53 320 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 SSX3Q99909 188 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 SPATA2Q9UM82 520 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 IRGMA1A4Y4 181 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 PRAF2O60831 178 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 S100A8P05109 93 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 MTNR1AP48039 350 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 WNT4P56705 351 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 COL10A1Q03692 680 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 AWAT1Q58HT5 328 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-212ENST00000548567 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.2□□□□□ -1.42
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