RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	CLPX	O76031	633 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	IL1A	P01583	271 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	ERVFRD-1	P60508	538 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM189A2	Q15884	450 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	NICN1	Q9BSH3	213 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	KIF25	Q9UIL4	384 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	COL6A5	A8TX70	2615 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	POM121C	A8CG34	1229 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	ODF3B	A8MYP8	253 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	HSPB6	O14558	160 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	CD34	P28906	385 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	CTF1	Q16619	201 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	LHX4	Q969G2	390 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	IFNA2	P01563	188 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	MT-ND4	P03905	459 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	FPR2	P25090	351 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	TGFBR1	P36897	503 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM50B	P56557	158 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	PLA2G7	Q13093	441 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	MIDN	Q504T8	468 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ETV7	Q9Y603	341 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	C15orf65	H3BRN8	121 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB27B	O00194	218 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ORC5	O43913	435 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	NAPSA	O96009	420 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	EFNB2	P52799	333 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	HILS1	P60008	231 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	KLRD1	Q13241	179 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF626	Q68DY1	528 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	GPR141	Q7Z602	305 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	DYRK2	Q92630	601 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	AJUBA	Q96IF1	538 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC6A7	Q99884	636 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ETAA1	Q9NY74	926 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	CALY	Q9NYX4	217 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A0B4J203	849 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SMIM30	A4D0T7	59 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	NPFF	O15130	113 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SOCS1	O15524	211 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	MMP23A	O75900	390 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	GZMH	P20718	246 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	GLP1R	P43220	463 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	DLX1	P56177	255 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	NCS1	P62166	190 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	MXD1	Q05195	221 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	OR52W1	Q6IF63	320 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	BRICD5	Q6PL45	260 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	KIRREL1	Q96J84	757 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	CYYR1	Q96J86	154 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25

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