RNA–Protein interactions for RNA: YPR013C

CMR3, Transcript of Putative zinc finger protein, yeast

Gene CMR3, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMR3	YPR013C	VPS8	P39702	1274 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	PUG1	P40100	303 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	GID8	P40208	455 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	PSF2	P40359	213 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	IMA5	P40884	581 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	MAD2	P40958	196 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	PFA3	P42836	336 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	NSE5	Q03718	556 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	TRI1	Q05024	226 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	ASM4	Q05166	528 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	SGD1	Q06132	899 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	GPR1	Q12361	961 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	SAN1	P22470	610 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	CLB4	P24871	460 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	SED4	P25365	1065 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	ADP1	P25371	1049 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	YHR033W	P38690	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	TAF4	P50105	388 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	SAP4	P53036	818 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	MNT2	P53059	558 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	DIN7	Q12086	430 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	POL3	P15436	1097 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	SIR1	P21691	654 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	COQ2	P32378	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	MRPL36	P36531	177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	PXA1	P41909	870 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	BNA1	P47096	177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	YNR071C	P53757	342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	ASI2	P53895	289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	REC102	Q02721	264 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	PPN1	Q04119	674 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	VID22	Q05934	901 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	SDH5	Q08230	162 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	SGO1	Q08490	590 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	UPC2	Q12151	913 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMR3	YPR013C	GAL10	P04397	699 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	MRP7	P12687	371 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	CHS2	P14180	963 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	IME1	P21190	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	CWH43	P25618	953 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	BLI1	P35727	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	APT2	P36973	181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	NPR3	P38742	1146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	UME6	P39001	836 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	VHR1	P40522	640 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	TPO1	Q07824	586 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	HOS1	Q12214	470 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
CMR3	YPR013C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	PAH1	P32567	862 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	YBR259W	P38338	688 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	AXL2	P38928	823 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	BUD8	P41698	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	VTC2	P43585	828 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	CTF18	P49956	741 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	PEF1	P53238	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	CBK1	P53894	756 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	PKH1	Q03407	766 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	MCM21	Q06675	368 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	ADY3	Q07732	790 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	AAD4	Q07747	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	SWM1	Q12379	170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	YLR415C	O13578	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	AAC3	P18238	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	STE14	P32584	239 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	TAT1	P38085	619 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	YER010C	P40011	234 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	CRD1	Q07560	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMR3	YPR013C	TRM8	Q12009	286 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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