RNA–Protein interactions for RNA: YMR025W

CSI1, Transcript of Subunit of the Cop9 signalosome, yeast

Gene CSI1, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI1	YMR025W	APL3	P38065	1025 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	PMT6	P42934	759 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	TAX4	P47030	604 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	ULA1	Q12059	462 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	AIM14	P53109	570 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	VPS36	Q06696	566 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	POM34	Q12445	299 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	TPK2	P06245	380 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	HMG1	P12683	1054 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	APN1	P22936	367 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	NUP82	P40368	713 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	DIP5	P53388	608 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	ATG33	Q06485	197 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	RGT2	Q12300	763 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	COS111	P38308	924 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	YHR202W	P38887	602 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	BUD6	P41697	788 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	YJR039W	P47107	1121 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	YFT2	Q06676	274 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	PCL2	P25693	308 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	MSH2	P25847	964 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	NTH1	P32356	751 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	SNF12	P53628	566 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	DCS2	Q12123	353 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	YLR125W	Q12138	136 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	MBR1	P23493	339 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	YPT7	P32939	208 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	PEX6	P33760	1030 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	UFO1	Q04511	668 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CSI1	YMR025W	PHO8	P11491	566 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	SEC15	P22224	910 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	BIT61	P47041	543 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	SCS3	P53012	380 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	UGO1	Q03327	502 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	COG8	Q04632	607 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	ARG7	Q04728	441 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	VHS3	Q08438	674 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	GIN4	Q12263	1142 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	ELF1	P36053	145 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	HOT13	P36078	116 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	IZH3	Q07959	543 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	KIN82	P25341	720 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	PET127	P32606	800 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	YEL1	P34225	687 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	MPS1	P54199	764 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	SFL1	P20134	766 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	THI4	P32318	326 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	AAD3	P25612	363 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	BEM4	P39011	633 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	YGL117W	P53133	265 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	STE4	P18851	423 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	PIP2	P52960	996 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	CPR8	P53728	308 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	STP1	Q00947	519 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	TRS23	Q03784	219 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	CIR2	Q08822	631 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CSI1	YMR025W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	YUR1	P26725	428 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	YKR075C	P36155	307 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	OCA5	P38738	679 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	NTG2	Q08214	380 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	YKU70	P32807	602 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	MAL31	P38156	614 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	YMR210W	Q03649	449 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	MET13	P53128	600 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	YLR407W	Q06070	228 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	ORM2	Q06144	216 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	GEP3	Q08622	556 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	IME1	P21190	360 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	YPS7	Q06325	596 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	FRE7	Q12333	620 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	PMA2	P19657	947 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	RIM4	P38741	713 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	TMN3	P40071	706 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	BUD8	P41698	603 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	THI6	P41835	540 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	TDA9	Q04545	1251 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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