RNA–Protein interactions for RNA: YML080W

DUS1, Transcript of Dihydrouridine synthase, yeast

Gene DUS1, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DUS1	YML080W	MSR1	P38714	643 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	MND1	P53102	219 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	SHE9	Q04172	456 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	WHI2	P12611	486 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	GAL11	P19659	1081 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	GYP6	P32806	458 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	REV7	P38927	245 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	ULI1	P43604	169 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	ATG36	P46983	293 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	ACF4	P47129	309 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	COX4	P04037	155 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	IMA3	P0CW40	589 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	IMA4	P0CW41	589 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	POX1	P13711	748 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	AFT1	P22149	690 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	MGT1	P26188	188 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	HSM3	P38348	480 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	SPR3	P41901	512 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	CDC55	Q00362	526 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	AIM39	Q08223	395 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	IMA2	Q08295	589 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	VHS3	Q08438	674 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	HVG1	P0CE11	249 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	SLY1	P22213	666 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	YJR054W	P47114	497 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	TRE1	Q08919	783 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	ZPS1	Q12512	249 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	JIP3	O13555	125 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	GLN3	P18494	730 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	KDX1	P36005	433 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	FLR1	P38124	548 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	KHA1	P40309	873 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	RSM26	P47141	266 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	ALT1	P52893	592 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	TAF6	P53040	516 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	RTA1	P53047	317 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.78	□□□□□ -0.68	not detected
DUS1	YML080W	GTR1	Q00582	310 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	VPS72	Q03388	795 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	CST9	Q06032	482 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	YLR455W	Q06188	304 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	YPR027C	Q12079	277 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	GPM3	Q12326	303 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DUS1	YML080W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	SNA3	P14359	133 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	MSS51	P32335	436 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	MRE11	P32829	692 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	YBL036C	P38197	257 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	YAP1801	P38856	637 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	LYS9	P38999	446 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	ILM1	P47155	203 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	SCS3	P53012	380 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	FMP25	Q08023	583 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	VPS5	Q92331	675 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	CHS1	P08004	1131 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	MEI4	P29467	408 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	BCS1	P32839	456 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	BUD2	P33314	1104 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	FLC2	P39719	783 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	SAW1	P39735	261 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	YIL054W	P40524	105 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	PEX21	P50091	288 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	PCL10	P53124	433 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	JIP4	Q03361	876 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	ARO80	Q04052	950 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	YLR177W	Q06251	628 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	MET7	Q08645	548 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	MAS2	P11914	482 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	BAS1	P22035	811 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	VBA3	P25594	458 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	PRR1	P28708	518 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	GPT2	P36148	743 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	VBA5	P36172	582 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DUS1	YML080W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 78.5 ms