RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeastyeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11YML043C IRC24P40580 263 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C SAP185P40856 1058 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C SNZ3P43545 298 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C DAS1P47005 663 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C MDV1P47025 714 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C RNR4P49723 345 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C TEL2P53038 688 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C MDR1P53258 950 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C SNZ2P53824 298 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C SQS1P53866 767 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C COG6P53959 839 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C ATG17Q06410 417 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C ATG13Q06628 738 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C PPM2Q08282 695 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C SOG2Q08817 791 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C ATP16Q12165 160 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C BBP1Q12365 385 aa4.51□□□□□ -1.69
RRN11YML043C PDR12Q02785 1511 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C USO1P25386 1790 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C GCR1P07261 785 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C YMR085WP0CF18 432 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C UBC1P21734 215 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C PHO3P24031 467 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C HSP30P25619 332 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data4.5□□□□□ -1.69not detected
RRN11YML043C DUR3P33413 735 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C SAS3P34218 831 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C ATP3P38077 311 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C REV7P38927 245 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C MNN1P39106 762 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C HUL4P40985 892 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C STB2P46679 850 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C NUT1P53114 1132 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C PCL10P53124 433 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C MAL13P53338 473 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C ALO1P54783 526 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C TAF12Q03761 539 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C YMR018WQ04364 514 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C DBP9Q06218 594 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C FAL1Q12099 399 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C RRP6Q12149 733 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C MSH5Q12175 901 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C MED4Q12343 284 aa4.5□□□□□ -1.69
RRN11YML043C DOP1Q03921 1698 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C COBP00163 385 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C SSB1P11484 613 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C BUD23P25627 275 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C ITR1P30605 584 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C XRS2P33301 854 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C UTP11P34247 250 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C TOM20P35180 183 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C YKL069WP36088 180 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C RTT105P40063 208 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C SSB2P40150 613 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C TRS85P46944 698 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C GCV2P49095 1034 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C SKP1P52286 194 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C TYW3P53177 273 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C ADA2Q02336 434 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C SWP1Q02795 286 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C COX20Q04935 205 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C ATG38Q05789 226 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C EMG1Q06287 252 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C CTI6Q08923 506 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C RSA1Q08932 381 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C YGR161W-CQ3E744 92 aa4.49□□□□□ -1.69
RRN11YML043C ILS1P09436 1072 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C DSF1P0CX08 502 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C YNR073CP0CX09 502 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C PHO8P11491 566 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C TPM1P17536 199 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C BAS1P22035 811 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C NAR1P23503 491 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C APL1P27351 700 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C TIM23P32897 222 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C VPS51P36116 164 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C SET3P36124 751 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C TAF5P38129 798 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C VMA22P38784 181 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C PEX18P38855 283 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C MBP1P39678 833 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C CCT5P40413 562 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C MNT3P40549 630 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C VTC2P43585 828 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C YGL176CP46945 554 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C FYV6P53913 173 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C FIN1Q03898 291 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C GIS4Q04233 774 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C UTP14Q04500 899 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C RNH1Q04740 348 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C GIC2Q06648 383 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C TMA46Q12000 345 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C SNT2P53127 1403 aa4.48□□□□□ -1.69
RRN11YML043C RPA190P10964 1664 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RRN11YML043C LAM4P38800 1345 aa4.47□□□□□ -1.69
RRN11YML043C AI3P03877 415 aa4.47□□□□□ -1.69
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