RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A PPN1Q04119 674 aa3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A MLH3Q12083 715 aa3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A CHS5Q12114 671 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A USV1Q12132 391 aa3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data3.1□□□□□ -1.91not detected
RPC10YHR143W-A TAF3Q12297 353 aa3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A RPS17AP02407 136 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A RPS17BP14127 136 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A FEN2P25621 512 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A NTH1P32356 751 aa3.09□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A OAF3P36023 863 aa3.09□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A GLG1P36143 616 aa3.09□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A CTR1P49573 406 aa3.09□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A GPG1P53130 126 aa3.09□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A SPO1P53541 631 aa3.09□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A NOP15P53927 220 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A ECM9Q02202 377 aa3.09□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A RPS9BP05755 195 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A IME1P21190 360 aa3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A SEC65P29478 273 aa3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A HXT6P39003 570 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A HXT7P39004 570 aa3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A YIL077CP40508 320 aa3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A GPP1P41277 250 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A CCT7P42943 550 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A RFX1P48743 811 aa3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A VPS73P53142 486 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A RCR2Q03446 210 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A NSE5Q03718 556 aa3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A YHM2Q04013 314 aa3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A HFI1Q12060 488 aa3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A SET3P36124 751 aa3.07□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A CTP1P38152 299 aa3.07□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A TDP1P38319 544 aa3.07□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A DUN1P39009 513 aa3.07□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A UBP12P39538 1254 aa3.07□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A YIL166CP40445 542 aa3.07□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A PXA1P41909 870 aa3.07□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A IES1P43579 692 aa3.07□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A MPS3P47069 682 aa3.07□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A TAH11P47112 604 aa3.07□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A ENP2P48234 707 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A GIS1Q03833 894 aa3.07□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A YPS7Q06325 596 aa3.07□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A YFT2Q06676 274 aa3.07□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A RPN13O13563 156 aa3.06□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A KCC4P25389 1037 aa3.06□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A FUB1P25659 250 aa3.06□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A GMH1P36125 273 aa3.06□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A COS111P38308 924 aa3.06□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A KHA1P40309 873 aa3.06□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A BUD8P41698 603 aa3.06□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A TAF4P50105 388 aa3.06□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A YGR151CP53287 111 aa3.06□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A HLR1Q04429 423 aa3.06□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A STP4Q07351 490 aa3.06□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A YDL086WQ07505 273 aa3.06□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data3.05□□□□□ -1.92not detected
RPC10YHR143W-A ILV6P25605 309 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A APL3P38065 1025 aa3.05□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A UBS1P38290 277 aa3.05□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A MUP3P38734 546 aa3.05□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A VID28P40547 921 aa3.05□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A DUG1P43616 481 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A RNR4P49723 345 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A APM1Q00776 475 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A FDC1Q03034 503 aa3.05□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A RKI1Q12189 258 aa3.05□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A SUT2Q12286 268 aa3.05□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A RMP1Q12530 201 aa3.05□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A GLN4P13188 809 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A SPO11P23179 398 aa3.04□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A MSS1P32559 526 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A GRX4P32642 244 aa3.04□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A FAT1P38225 669 aa3.04□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A KSP1P38691 1029 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A YEN1P40028 759 aa3.04□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A ATF1P40353 525 aa3.04□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A UFO1Q04511 668 aa3.04□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A IZH3Q07959 543 aa3.04□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A TRE2Q08693 809 aa3.04□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A CDC26P14724 124 aa3.03□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A AEP2P22136 580 aa3.03□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A ADY2P25613 283 aa3.03□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A PRE4P30657 266 aa3.03□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A PPZ2P33329 710 aa3.03□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A YHR097CP38809 366 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A YEL020CP39994 560 aa3.03□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A MRK1P50873 501 aa3.03□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A YPR027CQ12079 277 aa3.03□□□□□ -1.92
RPC10YHR143W-A LAM4P38800 1345 aa3.02□□□□□ -1.93
RPC10YHR143W-A TUB1P09733 447 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
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