RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	SWI6	P09959	803 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	SET3	P36124	751 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	TDP1	P38319	544 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	DUN1	P39009	513 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	YJL206C	P39529	758 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	FAT1	P38225	669 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	COS111	P38308	924 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	UBP12	P39538	1254 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	ARG2	P40360	574 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	CTR1	P49573	406 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	ATG4	P53867	494 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	TSR4	P25040	408 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	KIN82	P25341	720 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	DAL3	P32459	195 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	OAF3	P36023	863 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	BUD8	P41698	603 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	MPS3	P47069	682 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	YGR151C	P53287	111 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	STP4	Q07351	490 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	SUT2	Q12286	268 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	IME1	P21190	360 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	PRP28	P23394	588 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	SEC6	P32844	805 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	GLG1	P36143	616 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	UBS1	P38290	277 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	HFI1	Q12060	488 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	DMC1	P25453	334 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	YPT7	P32939	208 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	DID4	P36108	232 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	BDH2	P39713	417 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	VID28	P40547	921 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	PXA1	P41909	870 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	NMA2	P53204	395 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	YFT2	Q06676	274 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
RSM27	YGR215W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	FUB1	P25659	250 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	GRX4	P32642	244 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	TAH11	P47112	604 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	YGL081W	P53156	320 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RSM27	YGR215W	ABF1	P14164	731 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	KHA1	P40309	873 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	IES1	P43579	692 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	SPC98	P53540	846 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	TAF3	Q12297	353 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	NTH1	P32356	751 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	PPZ2	P33329	710 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	ELF1	P36053	145 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	GMH1	P36125	273 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	CTP1	P38152	299 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	YHR033W	P38690	423 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	TAF4	P50105	388 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	TIM50	Q02776	476 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	LAM4	P38800	1345 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	CDC26	P14724	124 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	EUG1	P32474	517 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	PEX2	P32800	271 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	EMP70	P32802	667 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	TMN3	P40071	706 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	YJR120W	P47157	116 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	DIP5	P53388	608 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	SPO1	P53541	631 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	PPN1	Q04119	674 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	TMA17	Q12513	150 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	RMP1	Q12530	201 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	APM4	Q99186	491 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	TUP1	P16649	713 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	KCC4	P25389	1037 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
RSM27	YGR215W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	TRE2	Q08693	809 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	RKI1	Q12189	258 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	BNR1	P40450	1375 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	ATP12	P22135	325 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	SPO11	P23179	398 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	PRE4	P30657	266 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	DGR2	P32330	852 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	APL3	P38065	1025 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RSM27	YGR215W	YIL166C	P40445	542 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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