RNA–Protein interactions for RNA: YDR138W

HPR1, Transcript of Subunit of THO/TREX complexes, yeast

Gene HPR1, Length 2,259 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HPR1	YDR138W	YDL183C	P48569	320 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	SSL2	Q00578	843 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	VPS36	Q06696	566 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	AI3	P03877	415 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	NUC1	P08466	329 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	SIR1	P21691	654 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	STE14	P32584	239 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	FMP10	P40098	244 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	IRC6	P43615	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	PHO5	P00635	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	CDC16	P09798	840 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	ARG1	P22768	420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	SFA1	P32771	386 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	SLC1	P33333	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	ESL2	P36168	1195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	SAK1	P38990	1142 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	PFA3	P42836	336 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	GRC3	Q07845	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	RSB1	Q08417	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	VPS5	Q92331	675 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	URA3	P03962	267 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	OPI1	P21957	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	CLB4	P24871	460 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	APL1	P27351	700 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	DGR2	P32330	852 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	AIM26	P32858	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	SEG2	P34250	1132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	UBS1	P38290	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	MSS4	P38994	779 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	SDP1	P40479	209 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	PUS2	P53167	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	SNO4	Q04902	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	VHS3	Q08438	674 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	HSP32	Q08992	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	ENT1	Q12518	454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	BLI1	P35727	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	SDS22	P36047	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	MMM1	P41800	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	PEF1	P53238	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	CBK1	P53894	756 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	GCR2	Q01722	534 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	HPF1	Q05164	967 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	PSR1	Q07800	427 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	PRE4	P30657	266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	YHR078W	P38799	552 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	NPR2	P39923	615 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	SEM1	O94742	89 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	HSF1	P10961	833 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	SIP4	P46954	829 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	EXG2	P52911	562 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	MRPS35	P53292	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	ICL2	Q12031	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	BET2	P20133	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	YKR075C	P36155	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	YBR225W	P38321	900 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	PTC7	P38797	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	PSF2	P40359	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	LYS14	P40971	790 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	TRE1	Q08919	783 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	UPC2	Q12151	913 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	RIT1	P23796	513 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	APN2	P38207	520 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	YHR112C	P38716	378 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	GTS1	P40956	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	YFL066C	P43538	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	PRY1	P47032	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	TAF4	P50105	388 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	AAD4	Q07747	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	CIR2	Q08822	631 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
HPR1	YDR138W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	SPE1	P08432	466 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	MRP7	P12687	371 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HPR1	YDR138W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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