RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447232.6

PMS1-215, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 2,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-215	ENST00000447232	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	COG3	Q96JB2	828 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	LAMA3	Q16787	3333 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	COL15A1	P39059	1388 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	ALDH1A1	P00352	501 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	FLT4	P35916	1363 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PMS1-215	ENST00000447232	SPTLC1	O15269	473 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	KCNH2	Q12809	1159 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	SCN7A	Q01118	1682 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	ERBB4	Q15303	1308 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	OLFM4	Q6UX06	510 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	TREML4	Q6UXN2	200 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	BAP1	Q92560	729 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	CFAP99	D6REC4	459 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	PDE4D	Q08499	809 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	LYPD8	Q6UX82	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	PSMD1	Q99460	953 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	GPR25	O00155	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	PLA2G5	P39877	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	LINC01559	Q495D7	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	TMC1	Q8TDI8	760 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232		A0A1W2PPC1	479 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	ZNF511	Q8NB15	262 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	MRC1	P22897	1456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	NPR1	P16066	1061 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	CABP4	P57796	275 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	TRIM47	Q96LD4	638 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	FKTN	O75072	461 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	USP48	Q86UV5	1035 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	TTC28	Q96AY4	2481 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	ST5	P78524	1137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	QPCT	Q16769	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	SENP2	Q9HC62	589 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	FYB1	O15117	783 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	CTH	P32929	405 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	MAP10	Q9P2G4	905 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMS1-215	ENST00000447232	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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