RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 TBC1D2Q9BYX2 928 aa11.95□□□□□ -0.5
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CLN8-201ENST00000331222 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.95□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 KANK3Q6NY19 840 aa11.95□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 DNAI1Q9UI46 699 aa11.95□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 RHOXF2BP0C7M4 288 aa11.95□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.95□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 RMND1Q9NWS8 449 aa11.95□□□□□ -0.5
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CLN8-201ENST00000331222 GNPATO15228 680 aa11.94□□□□□ -0.5
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CLN8-201ENST00000331222 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
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CLN8-201ENST00000331222 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
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CLN8-201ENST00000331222 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.94□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.93□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 ZNF174Q15697 407 aa11.93□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 PLVAPQ9BX97 442 aa11.93□□□□□ -0.5
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CLN8-201ENST00000331222 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.58e-6■■□□□ 11.9
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CLN8-201ENST00000331222 MNAT1P51948 309 aa11.93□□□□□ -0.5
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CLN8-201ENST00000331222 NEK11Q8NG66 645 aa11.93□□□□□ -0.5
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CLN8-201ENST00000331222 RABEP2Q9H5N1 569 aa11.93□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 ANAPC4Q9UJX5 808 aa11.93□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 CTNND2Q9UQB3 1225 aa11.93□□□□□ -0.5
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CLN8-201ENST00000331222 PTPRCP08575 1304 aa11.93□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 LDHBP07195 334 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 LETM2Q2VYF4 491 aa11.93□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 MSL1Q68DK7 614 aa11.93□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 GSDMDP57764 484 aa11.93□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 USP48Q86UV5 1035 aa11.93□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 LRRC27Q9C0I9 530 aa11.93□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 C4orf50Q6ZRC1 276 aa11.93□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 CPXCR1Q8N123 301 aa11.93□□□□□ -0.5
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CLN8-201ENST00000331222 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa11.92□□□□□ -0.5
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CLN8-201ENST00000331222 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
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CLN8-201ENST00000331222 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 MSH6P52701 1360 aa11.92□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 TMOD4Q9NZQ9 345 aa11.92□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 CTAGE9A4FU28 777 aa11.92□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 KRT19P08727 400 aa11.92□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa11.92□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 UBE2HP62256 183 aa11.92□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 ZRANB1Q9UGI0 708 aa11.92□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 SYT1P21579 422 aa11.91□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 ALDH1L2Q3SY69 923 aa11.91□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 IGHDP01880 384 aa11.91□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 CNGA1P29973 690 aa11.91□□□□□ -0.5
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CLN8-201ENST00000331222 SDSP20132 328 aa11.91□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 HSPA4P34932 840 aa11.91□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 SMC6Q96SB8 1091 aa11.91□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 DTHD1Q6ZMT9 781 aa11.91□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 TRIM7Q9C029 511 aa11.91□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 NYXQ9GZU5 481 aa11.91□□□□□ -0.5
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CLN8-201ENST00000331222 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.91□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.91□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 NBPF14Q5TI25 921 aa11.91□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 CEP57Q86XR8 500 aa11.91□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 ZNF569Q5MCW4 686 aa11.9□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 GRM8O00222 908 aa11.9□□□□□ -0.5
CLN8-201ENST00000331222 DAPK1P53355 1430 aa11.9□□□□□ -0.5
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