RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000174113.7

Sumo3-209, Transcript of Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene Sumo3, Length 512 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mapkapk5O54992 473 aa23.99■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fgl2P12804 432 aa23.99■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 SpidrQ8BGX7 933 aa23.99■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Lama2Q60675 3118 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Col11a1Q61245 1804 aa23.98■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 CrkQ64010 304 aa23.98■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pank1Q8K4K6 548 aa23.98■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ccne2Q9Z238 404 aa23.98■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Triml2E9PW10 424 aa23.97■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa23.97■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pcdhb5Q91XZ5 792 aa23.97■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 EhhadhQ9DBM2 718 aa23.97■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Nphp3Q7TNH6 1325 aa23.96■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Timm10P62073 90 aa23.96■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Map3k12Q60700 888 aa23.96■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ift57Q8BXG3 429 aa23.96■■□□□ 1.43
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Atp8b2P98199 1209 aa23.95■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Secisbp2lQ6A098 1086 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Izumo3A6PWV3 263 aa23.94■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tmprss11eQ5S248 423 aa23.94■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa23.94■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Sirt2Q8VDQ8 389 aa23.94■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Zbtb3Q91X45 518 aa23.94■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 NsmfQ99NF2 532 aa23.94■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa23.93■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa23.93■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Psen2Q61144 448 aa23.93■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Trpv1Q704Y3 839 aa23.93■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa23.93■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 ParnQ8VDG3 624 aa23.93■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fam84aQ9D650 292 aa23.93■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Prkg1P0C605 671 aa23.92■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Neurod6P48986 337 aa23.92■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Traf5P70191 558 aa23.92■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Kif22Q3V300 660 aa23.92■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Srgap3Q812A2 1099 aa23.92■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fam102bQ8BQS4 339 aa23.92■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Jag1Q9QXX0 1218 aa23.92■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Bcorl1A2AQH4 1781 aa23.92■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gm3893E9Q1I1 302 aa23.91■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Usp17ldG5E8G2 545 aa23.91■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Usp17lcG5E8I7 545 aa23.91■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gsdma2Q32M21 443 aa23.91■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Trim58Q5NCC9 485 aa23.91■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pram1Q6BCL1 675 aa23.91■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rwdd1Q9CQK7 243 aa23.91■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rnf181Q9CY62 165 aa23.91■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 MycnP03966 462 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gxylt1Q3UHH8 404 aa23.9■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 NfkbibQ60778 359 aa23.9■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tmem179Q8BHH9 233 aa23.9■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 S1pr4Q9Z0L1 386 aa23.9■■□□□ 1.42
Sumo3-209ENSMUST00000174113 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Uba5Q8VE47 403 aa23.89■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa23.88■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 TsksO54887 585 aa23.88■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tm4sf1Q64302 202 aa23.88■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mboat7Q8CHK3 473 aa23.88■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Snap47Q8R570 413 aa23.88■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Bcs1lQ9CZP5 418 aa23.88■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mkrn1Q9QXP6 481 aa23.88■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Myh3P13541 1940 aa23.88■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cacnb3P54285 484 aa23.87■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Klrg2Q3UM83 387 aa23.87■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mansc4Q3UU94 337 aa23.87■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa23.87■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Skint7A7XV04 395 aa23.86■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 CnpP16330 420 aa23.86■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 L3mbtl2P59178 703 aa23.86■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Senp5Q6NXL6 749 aa23.86■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tmem39bQ810L4 492 aa23.86■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Prss51A0A286YDY8 319 aa23.85■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Slc4a1P04919 929 aa23.85■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Serpinb2P12388 415 aa23.85■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Itgb7P26011 806 aa23.85■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa23.85■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 AsnsQ61024 561 aa23.85■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Krt74Q6IFZ9 495 aa23.85■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Adam39Q7M762 756 aa23.85■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Abcc4E9Q236 1325 aa23.84■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mapk4Q6P5G0 583 aa23.84■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Txnrd3Q99MD6 652 aa23.84■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tm6sf1P58749 370 aa23.83■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Lgr6Q3UVD5 967 aa23.83■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Nlrp9aQ66X03 949 aa23.83■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ankrd13aQ80UP5 588 aa23.83■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Borcs6Q9D6W8 360 aa23.83■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cry2Q9R194 592 aa23.83■■□□□ 1.41
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Slc7a3P70423 618 aa23.82■■□□□ 1.4
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ccdc148Q6P5U8 527 aa23.82■■□□□ 1.4
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Asap2Q7SIG6 958 aa23.82■■□□□ 1.4
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Sulf1Q8K007 870 aa23.82■■□□□ 1.4
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.8 ms