Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46,31■■■■■ 5
Itgb7P26011 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43,18■■■■■ 4,5
Itgb7P26011 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,5■■■■■ 4,39
Itgb7P26011 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,52■■■■■ 4,08
Itgb7P26011 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,72■■■■□ 3,95
Itgb7P26011 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39,2■■■■□ 3,87
Itgb7P26011 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
Itgb7P26011 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Itgb7P26011 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38,7■■■■□ 3,79
Itgb7P26011 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Itgb7P26011 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,59■■■■□ 3,77
Itgb7P26011 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38,05■■■■□ 3,68
Itgb7P26011 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,75■■■■□ 3,63
Itgb7P26011 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Itgb7P26011 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,62■■■■□ 3,61
Itgb7P26011 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,58■■■■□ 3,61
Itgb7P26011 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
Itgb7P26011 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Itgb7P26011 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,9■■■■□ 3,5
Itgb7P26011 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,85■■■■□ 3,49
Itgb7P26011 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Itgb7P26011 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,79■■■■□ 3,48
Itgb7P26011 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Itgb7P26011 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Itgb7P26011 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Itgb7P26011 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,66■■■■□ 3,3
Itgb7P26011 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Itgb7P26011 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,56■■■■□ 3,28
Itgb7P26011 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Itgb7P26011 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Itgb7P26011 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Itgb7P26011 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Itgb7P26011 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35,23■■■■□ 3,23
Itgb7P26011 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Itgb7P26011 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35,18■■■■□ 3,22
Itgb7P26011 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Itgb7P26011 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35,09■■■■□ 3,21
Itgb7P26011 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Itgb7P26011 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Itgb7P26011 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,93■■■■□ 3,18
Itgb7P26011 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,88■■■■□ 3,17
Itgb7P26011 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Itgb7P26011 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Itgb7P26011 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Itgb7P26011 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,77■■■■□ 3,16
Itgb7P26011 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Itgb7P26011 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,67■■■■□ 3,14
Itgb7P26011 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Itgb7P26011 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,56■■■■□ 3,12
Itgb7P26011 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,56■■■■□ 3,12
Itgb7P26011 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,45■■■■□ 3,11
Itgb7P26011 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Itgb7P26011 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Itgb7P26011 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Itgb7P26011 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Itgb7P26011 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Itgb7P26011 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Itgb7P26011 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Itgb7P26011 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Itgb7P26011 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Itgb7P26011 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Itgb7P26011 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Itgb7P26011 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Itgb7P26011 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Itgb7P26011 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Itgb7P26011 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Itgb7P26011 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Itgb7P26011 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Itgb7P26011 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33,57■■■□□ 2,96
Itgb7P26011 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,53■■■□□ 2,96
Itgb7P26011 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Itgb7P26011 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Itgb7P26011 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Itgb7P26011 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Itgb7P26011 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,35■■■□□ 2,93
Itgb7P26011 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Itgb7P26011 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Itgb7P26011 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,17■■■□□ 2,9
Itgb7P26011 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Itgb7P26011 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Itgb7P26011 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33,12■■■□□ 2,89
Itgb7P26011 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Itgb7P26011 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,09■■■□□ 2,89
Itgb7P26011 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33■■■□□ 2,87
Itgb7P26011 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Itgb7P26011 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Itgb7P26011 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32,95■■■□□ 2,87
Itgb7P26011 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Itgb7P26011 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Itgb7P26011 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Itgb7P26011 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,88■■■□□ 2,85
Itgb7P26011 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,87■■■□□ 2,85
Itgb7P26011 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Itgb7P26011 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Itgb7P26011 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Itgb7P26011 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Itgb7P26011 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Itgb7P26011 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Itgb7P26011 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32,8■■■□□ 2,84
Itgb7P26011 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms