RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 LGALS14Q8TCE9 139 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 FOXC2Q99958 501 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 RHOFQ9HBH0 211 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 SPG11Q96JI7 2443 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 AKAP9Q99996 3911 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 A6NJY4 79 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 VWC2LB2RUY7 222 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 PAHP00439 452 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 KNG1P01042 644 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 PSG2P11465 335 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 GABRR1P24046 479 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 DUSP1P28562 367 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 NR4A2P43354 598 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 GABRA2P47869 451 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 QRFPP83859 136 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 SCN1BQ07699 218 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 PLA2G7Q13093 441 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 IKZF1Q13422 519 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 PDCD1Q15116 288 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 KCNJ8Q15842 424 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 STUMQ69YW2 141 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 DNM1P46Q6ZS02 220 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 OR2W3Q7Z3T1 314 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 Q8NFD4 153 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 OR51T1Q8NGJ9 327 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 OR5H6Q8NGV6 325 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 AP3S1Q92572 193 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 Q96MF0 132 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 CCL13Q99616 98 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 GAL3ST1Q99999 423 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM165Q9HC07 324 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 GLS2Q9UI32 602 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.12□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 SIRPB1O00241 398 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 SH2D1BO14796 132 aa7.11□□□□□ -1.27
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SGMS1-211ENST00000626236 TMEM127O75204 238 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 FSTL3O95633 263 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 HAND1O96004 215 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF44P15621 663 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 PRDX2P32119 198 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 EFNB2P52799 333 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF146Q15072 292 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 TAF9Q16594 264 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 SHEQ5VZ18 495 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 TREML4Q6UXN2 200 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 LINC00596Q86U02 117 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 SPICQ8N5J4 248 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 CD177Q8N6Q3 437 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 Q96M66 194 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 NICN1Q9BSH3 213 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 MRI1Q9BV20 369 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF222Q9UK12 451 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 RAB22AQ9UL26 194 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 SPATA2Q9UM82 520 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 ETV7Q9Y603 341 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 ARID1AO14497 2285 aa7.11□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1B0GW55 424 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.1□□□□□ -1.27
SGMS1-211ENST00000626236 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
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