RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000035340.13

Usp54-202, Transcript of Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Usp54, Length 6,495 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54-202ENSMUST00000035340 Nt5dc2Q91X76 390 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Asb9Q91ZT8 290 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Olfr661Q99NH4 319 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Dtwd2Q9D0U1 298 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Tnfsf14Q9QYH9 239 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Gm12117V9GXK0 151 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Zbtb25G3UW50 439 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 AF067061O70616 171 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 GbaP17439 515 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Plk3Q60806 631 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Foxj3Q8BUR3 623 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Lmf2Q8C3X8 702 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 GmdsQ8K0C9 372 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Seh1lQ8R2U0 360 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Mrpl24Q9CQ06 216 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Klhdc8bQ9D2D9 354 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Izumo1rQ9EQF4 244 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Igkv10-94A0A075B5L1 115 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Vmn1r122K7N726 305 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Degs1O09005 323 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Rab33bO35963 229 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Egr3P43300 387 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Rab1AP62821 205 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 CpeQ00493 476 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Fxyd2Q04646 70 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Serinc4Q5XK03 492 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 IdnkQ8R0J8 184 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Hoga1Q9DCU9 321 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Riox1Q9JJF3 603 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 CtsjQ9R014 334 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Cx3cr1Q9Z0D9 354 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Trbc1A0A0A6YWV4 173 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Olfr721-ps1A0A140T8T9 324 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Rbm24D3Z4I3 236 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 P01852 173 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Nkx2-1P50220 372 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Efna1P52793 205 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Pip5k1aP70182 546 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Cdk2P97377 346 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 CxadrP97792 365 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Ccbe1Q3MI99 408 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Samt2Q497M0 247 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Slc25a26Q5U680 274 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Rph3alQ768S4 302 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Cggbp1Q8BHG9 167 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 YbeyQ8CAV0 164 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Eddm3bQ8K0E4 149 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Slc38a1Q8K2P7 485 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Olfr1301Q8VGE7 312 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Dus3lQ91XI1 637 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Slc52a3Q9D6X5 460 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 1700080O16RikQ9D9G4 284 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Dda1Q9D9Z5 102 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Dll4Q9JI71 686 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Pfdn5Q9WU28 154 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Tusc2Q9WVF8 110 aa6.99□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Glb1l3A2RSQ1 649 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Olfr750E9Q0Z1 331 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Foxd2O35392 492 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Klk1b1P00755 261 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Ptpn6P29351 595 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Fam160a2Q3U2I3 975 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 ShfQ8CG80 238 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Tmem221Q8K071 230 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Rtn4rl1Q8K0S5 445 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Vmn1r85Q8VIB8 308 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Abhd17aQ99JW1 310 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Rnf141Q99MB7 230 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Rpl11Q9CXW4 178 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Tnfsf13Q9D777 241 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Shisa5Q9D7I0 235 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Eif3fQ9DCH4 361 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Fgf20Q9ESL9 211 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Arl3Q9WUL7 182 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Dcst2A0A140LIJ0 701 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Olfr585E9PXW4 318 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Olfr66F8VQ01 311 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Vmn1r67G5E8C1 305 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Raet1aO08602 253 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Raet1bO08603 253 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Sp100O35892 482 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 P2rx6O54803 389 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 GdnfP48540 211 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Chrna7P49582 502 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Uck1P52623 277 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Vmn1r15Q14C10 299 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Mcrip1Q3UGS4 97 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Fbxo27Q6DIA9 280 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Gramd2bQ6PEM6 445 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Olfr988Q7TRA1 309 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Slc22a20Q80UJ1 556 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Acp7Q8BX37 438 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Olfr536Q8VFE9 307 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Olfr27Q9EQ90 311 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Olfr944Q9EQ91 311 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Trex2Q9R1A9 236 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 StrapQ9Z1Z2 350 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Myh9Q8VDD5 1960 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Olfr1274-psA0A1L1SQ02 309 aa6.98□□□□□ -1.29
Usp54-202ENSMUST00000035340 Vmn2r16E9Q025 850 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 59.4 ms