Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Shisa5Q9D7I0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Shisa5Q9D7I0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Shisa5Q9D7I0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Shisa5Q9D7I0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Shisa5Q9D7I0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Shisa5Q9D7I0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Shisa5Q9D7I0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Shisa5Q9D7I0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Shisa5Q9D7I0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shisa5Q9D7I0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Shisa5Q9D7I0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Shisa5Q9D7I0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Shisa5Q9D7I0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Shisa5Q9D7I0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Shisa5Q9D7I0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shisa5Q9D7I0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Shisa5Q9D7I0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shisa5Q9D7I0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Shisa5Q9D7I0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Shisa5Q9D7I0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Shisa5Q9D7I0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shisa5Q9D7I0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Shisa5Q9D7I0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shisa5Q9D7I0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shisa5Q9D7I0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shisa5Q9D7I0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Shisa5Q9D7I0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Shisa5Q9D7I0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Shisa5Q9D7I0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Shisa5Q9D7I0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Shisa5Q9D7I0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shisa5Q9D7I0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Shisa5Q9D7I0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shisa5Q9D7I0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shisa5Q9D7I0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shisa5Q9D7I0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Shisa5Q9D7I0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shisa5Q9D7I0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shisa5Q9D7I0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Shisa5Q9D7I0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Shisa5Q9D7I0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Shisa5Q9D7I0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shisa5Q9D7I0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Shisa5Q9D7I0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Shisa5Q9D7I0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shisa5Q9D7I0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Shisa5Q9D7I0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Shisa5Q9D7I0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shisa5Q9D7I0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Shisa5Q9D7I0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Shisa5Q9D7I0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Shisa5Q9D7I0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Shisa5Q9D7I0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Shisa5Q9D7I0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Shisa5Q9D7I0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Shisa5Q9D7I0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Shisa5Q9D7I0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shisa5Q9D7I0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shisa5Q9D7I0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shisa5Q9D7I0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Shisa5Q9D7I0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Shisa5Q9D7I0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shisa5Q9D7I0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shisa5Q9D7I0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Shisa5Q9D7I0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Shisa5Q9D7I0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Shisa5Q9D7I0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Shisa5Q9D7I0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Shisa5Q9D7I0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Shisa5Q9D7I0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Shisa5Q9D7I0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Shisa5Q9D7I0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Shisa5Q9D7I0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shisa5Q9D7I0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shisa5Q9D7I0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shisa5Q9D7I0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shisa5Q9D7I0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shisa5Q9D7I0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shisa5Q9D7I0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Shisa5Q9D7I0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Shisa5Q9D7I0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Shisa5Q9D7I0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Shisa5Q9D7I0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shisa5Q9D7I0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shisa5Q9D7I0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shisa5Q9D7I0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shisa5Q9D7I0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shisa5Q9D7I0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shisa5Q9D7I0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Shisa5Q9D7I0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shisa5Q9D7I0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shisa5Q9D7I0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shisa5Q9D7I0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shisa5Q9D7I0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shisa5Q9D7I0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shisa5Q9D7I0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shisa5Q9D7I0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shisa5Q9D7I0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shisa5Q9D7I0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms