Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Rab1AP62821 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rab1AP62821 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rab1AP62821 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rab1AP62821 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rab1AP62821 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Rab1AP62821 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rab1AP62821 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rab1AP62821 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab1AP62821 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab1AP62821 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rab1AP62821 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab1AP62821 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab1AP62821 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rab1AP62821 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab1AP62821 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab1AP62821 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab1AP62821 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab1AP62821 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rab1AP62821 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab1AP62821 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab1AP62821 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab1AP62821 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab1AP62821 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab1AP62821 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rab1AP62821 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rab1AP62821 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rab1AP62821 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rab1AP62821 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab1AP62821 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rab1AP62821 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab1AP62821 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Rab1AP62821 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rab1AP62821 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rab1AP62821 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rab1AP62821 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab1AP62821 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab1AP62821 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab1AP62821 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Rab1AP62821 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab1AP62821 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab1AP62821 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab1AP62821 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rab1AP62821 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rab1AP62821 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab1AP62821 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab1AP62821 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab1AP62821 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rab1AP62821 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab1AP62821 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab1AP62821 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab1AP62821 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab1AP62821 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab1AP62821 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab1AP62821 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab1AP62821 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab1AP62821 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab1AP62821 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab1AP62821 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab1AP62821 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab1AP62821 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab1AP62821 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab1AP62821 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab1AP62821 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab1AP62821 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab1AP62821 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab1AP62821 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab1AP62821 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab1AP62821 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab1AP62821 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab1AP62821 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab1AP62821 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab1AP62821 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab1AP62821 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab1AP62821 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab1AP62821 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab1AP62821 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab1AP62821 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab1AP62821 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab1AP62821 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab1AP62821 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab1AP62821 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab1AP62821 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab1AP62821 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab1AP62821 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rab1AP62821 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rab1AP62821 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab1AP62821 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab1AP62821 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab1AP62821 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab1AP62821 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab1AP62821 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab1AP62821 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab1AP62821 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab1AP62821 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab1AP62821 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab1AP62821 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab1AP62821 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab1AP62821 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab1AP62821 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms