Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Sp100O35892 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sp100O35892 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sp100O35892 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sp100O35892 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sp100O35892 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sp100O35892 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sp100O35892 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sp100O35892 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sp100O35892 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sp100O35892 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sp100O35892 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sp100O35892 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sp100O35892 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sp100O35892 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sp100O35892 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sp100O35892 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sp100O35892 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sp100O35892 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sp100O35892 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sp100O35892 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sp100O35892 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sp100O35892 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sp100O35892 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sp100O35892 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sp100O35892 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sp100O35892 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sp100O35892 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sp100O35892 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sp100O35892 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sp100O35892 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sp100O35892 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sp100O35892 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sp100O35892 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sp100O35892 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sp100O35892 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sp100O35892 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sp100O35892 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sp100O35892 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sp100O35892 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sp100O35892 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sp100O35892 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sp100O35892 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sp100O35892 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sp100O35892 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sp100O35892 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sp100O35892 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sp100O35892 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sp100O35892 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sp100O35892 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sp100O35892 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sp100O35892 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sp100O35892 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sp100O35892 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sp100O35892 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sp100O35892 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp100O35892 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sp100O35892 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sp100O35892 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sp100O35892 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sp100O35892 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sp100O35892 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sp100O35892 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sp100O35892 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp100O35892 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp100O35892 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sp100O35892 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sp100O35892 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp100O35892 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sp100O35892 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sp100O35892 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sp100O35892 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sp100O35892 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sp100O35892 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sp100O35892 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sp100O35892 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sp100O35892 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sp100O35892 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sp100O35892 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sp100O35892 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sp100O35892 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp100O35892 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sp100O35892 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sp100O35892 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sp100O35892 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sp100O35892 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sp100O35892 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sp100O35892 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sp100O35892 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sp100O35892 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sp100O35892 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sp100O35892 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sp100O35892 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sp100O35892 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sp100O35892 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sp100O35892 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sp100O35892 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sp100O35892 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sp100O35892 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sp100O35892 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.9 ms