Protein–RNA interactions for Protein: Q8K071

Tmem221, Transmembrane protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem221Q8K071 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Tmem221Q8K071 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tmem221Q8K071 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tmem221Q8K071 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tmem221Q8K071 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tmem221Q8K071 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmem221Q8K071 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Tmem221Q8K071 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmem221Q8K071 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem221Q8K071 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmem221Q8K071 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmem221Q8K071 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmem221Q8K071 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmem221Q8K071 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tmem221Q8K071 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmem221Q8K071 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmem221Q8K071 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tmem221Q8K071 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmem221Q8K071 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmem221Q8K071 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmem221Q8K071 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmem221Q8K071 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmem221Q8K071 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmem221Q8K071 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmem221Q8K071 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmem221Q8K071 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmem221Q8K071 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmem221Q8K071 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmem221Q8K071 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem221Q8K071 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmem221Q8K071 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmem221Q8K071 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmem221Q8K071 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tmem221Q8K071 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem221Q8K071 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmem221Q8K071 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem221Q8K071 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmem221Q8K071 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmem221Q8K071 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmem221Q8K071 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmem221Q8K071 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmem221Q8K071 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmem221Q8K071 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmem221Q8K071 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmem221Q8K071 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmem221Q8K071 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmem221Q8K071 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmem221Q8K071 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmem221Q8K071 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmem221Q8K071 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmem221Q8K071 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmem221Q8K071 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmem221Q8K071 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmem221Q8K071 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem221Q8K071 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem221Q8K071 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmem221Q8K071 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem221Q8K071 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem221Q8K071 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem221Q8K071 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem221Q8K071 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem221Q8K071 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem221Q8K071 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem221Q8K071 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem221Q8K071 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem221Q8K071 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem221Q8K071 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem221Q8K071 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem221Q8K071 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem221Q8K071 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem221Q8K071 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem221Q8K071 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem221Q8K071 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem221Q8K071 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmem221Q8K071 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem221Q8K071 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem221Q8K071 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem221Q8K071 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem221Q8K071 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem221Q8K071 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem221Q8K071 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem221Q8K071 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem221Q8K071 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem221Q8K071 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem221Q8K071 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem221Q8K071 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem221Q8K071 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem221Q8K071 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem221Q8K071 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem221Q8K071 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem221Q8K071 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmem221Q8K071 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem221Q8K071 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmem221Q8K071 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem221Q8K071 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem221Q8K071 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem221Q8K071 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem221Q8K071 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem221Q8K071 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem221Q8K071 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms