RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPACA5Q96QH8 159 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MICU1Q9BPX6 476 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RTL8AQ9BWD3 113 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RAB1BQ9H0U4 201 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SAP30LQ9HAJ7 183 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NOX4Q9NPH5 578 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UFSP2Q9NUQ7 469 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SCOCQ9UIL1 159 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AKAP6Q13023 2319 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 APCP25054 2843 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIM64CA6NLI5 447 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DHRS7CA6NNS2 312 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LYNX1G3V0Z9 82 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GABRPO00591 440 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GMDSO60547 372 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GATBO75879 557 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SERPINA3P01011 423 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CST4P01036 141 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HPXP02790 462 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HCKP08631 526 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LYNX1P0DP58 116 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GADD45AP24522 165 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 THBS2P35442 1172 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TGFBR2P37173 567 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZBTB37Q5TC79 503 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MS4A15Q8N5U1 240 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PP6455Q8WZ26 134 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RFT1Q96AA3 541 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMIGD2Q96BF3 282 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RNF170Q96K19 258 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MEGF10Q96KG7 1140 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DERL3Q96Q80 235 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CHST5Q9GZS9 411 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR51E2Q9H255 320 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CXXC4Q9H2H0 198 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MPC1Q9Y5U8 109 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ABCA12Q86UK0 2595 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TANC2Q9HCD6 1990 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UNC79Q9P2D8 2635 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF732B4DXR9 585 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 H7C417 338 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SSX4O60224 188 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CD1AP06126 327 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PTH2RP49190 550 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SRP9P49458 86 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATP5J2P56134 94 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPP3R1P63098 170 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPR50Q13585 617 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRAM1Q15629 374 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UBE2V2Q15819 145 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C22orf42Q6IC83 251 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MOGAT3Q86VF5 341 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SERPINA12Q8IW75 414 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BATF2Q8N1L9 274 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR51A2Q8NGJ7 313 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ITPKCQ96DU7 683 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DIRC2Q96SL1 478 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EGLN1Q9GZT9 426 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC22A4Q9H015 551 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CKLFQ9UBR5 152 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EDARQ9UNE0 448 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC7A11Q9UPY5 501 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CACNG2Q9Y698 323 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OVOL3O00110 214 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGHV4-39P01824 125 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAS1P04201 325 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATF1P18846 271 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RAB3AP20336 220 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CALRP27797 417 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GMFBP60983 142 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LSM3P62310 102 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MPPED2Q15777 294 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCGF3Q3KNV8 242 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HSD17B12Q53GQ0 312 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ASPHD2Q6ICH7 369 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM91Q6ZNR0 172 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 Q6ZSR3 168 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WDR86Q86TI4 376 aa12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms