RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M RLP24Q07915 199 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR387CQ08910 206 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M DDC1Q08949 612 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M LPX1Q12405 387 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M TRS33Q99394 268 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M FKS1P38631 1876 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC37P06101 506 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M GPA1P08539 472 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M MTF1P14908 341 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC42P19073 191 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M DAL2P25335 343 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M VBA3P25594 458 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M CAP1P28495 268 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M GUT1P32190 709 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M TCD2P36101 447 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YKR051WP36142 418 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M VBA5P36172 582 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M RFT1P38206 574 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M PPX1P38698 397 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M NEM1P38757 446 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M RPT2P40327 437 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M CCT5P40413 562 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M GUF1P46943 645 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M DAN4P47179 1161 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M COQ6P53318 479 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M GPD1Q00055 391 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M SMA1Q02651 245 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M INA17Q02888 182 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YPR084WQ06821 456 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M SPO75Q07798 868 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M FAL1Q12099 399 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M STB3Q12427 513 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M MSB2P32334 1306 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M RAD3P06839 778 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M MSF1P08425 469 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M HSF1P10961 833 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M PCT1P13259 424 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M ARF2P19146 181 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M KIN3P22209 435 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M MRC1P25588 1096 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M GPI10P30777 616 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M PSE1P32337 1089 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M ISF1P32488 338 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M SWE1P32944 819 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M CSG2P35206 410 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M SPT23P35210 1082 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YKT6P36015 200 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M SPT8P38915 602 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M DOT6P40059 670 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M DSE1P40077 573 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M UBP7P40453 1071 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M ERG10P41338 398 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M GYP8P43570 497 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M RMD8P43620 662 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YJR054WP47114 497 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M RSM26P47141 266 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL144CP53907 740 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M EBS1Q03466 884 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M TRE1Q08919 783 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M PIN2Q12057 282 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M GIS3Q12418 502 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YDL206WQ12424 762 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M ECM3Q99252 613 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M MPD2Q99316 277 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M DDP1Q99321 188 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR422WQ06409 1932 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M JIP3O13555 125 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M MAK16P10962 306 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M COX11P19516 300 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M SAT4P25333 603 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M MET4P32389 672 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M SMC1P32908 1225 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M CSE1P33307 960 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M NIP100P33420 868 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YET1P35723 206 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M KDX1P36005 433 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M NOP4P37838 685 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M GIP1P38229 639 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR053CP38235 358 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG12P38316 186 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M URA8P38627 578 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M QNS1P38795 714 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M NMD3P38861 518 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M FHL1P39521 936 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M BDH2P39713 417 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M SNF7P39929 240 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YEL075CP39972 122 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M PSY2P40164 858 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M DJP1P40564 432 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M UFE1P41834 346 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M LSB3P43603 459 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M STU2P46675 888 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M BFA1P47113 574 aa2.78□□□□□ -1.96
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