RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J RLP24Q07915 199 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR387CQ08910 206 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J DDC1Q08949 612 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J LPX1Q12405 387 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J TRS33Q99394 268 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J FKS1P38631 1876 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC37P06101 506 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J GPA1P08539 472 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J MTF1P14908 341 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC42P19073 191 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J DAL2P25335 343 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J VBA3P25594 458 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J CAP1P28495 268 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J GUT1P32190 709 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J TCD2P36101 447 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YKR051WP36142 418 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J VBA5P36172 582 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J RFT1P38206 574 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J PPX1P38698 397 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J NEM1P38757 446 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J RPT2P40327 437 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J CCT5P40413 562 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J GUF1P46943 645 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J DAN4P47179 1161 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J COQ6P53318 479 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J GPD1Q00055 391 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SMA1Q02651 245 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J INA17Q02888 182 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR084WQ06821 456 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SPO75Q07798 868 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J FAL1Q12099 399 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J STB3Q12427 513 aa2.8□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J MSB2P32334 1306 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD3P06839 778 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J MSF1P08425 469 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J HSF1P10961 833 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J PCT1P13259 424 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J ARF2P19146 181 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J KIN3P22209 435 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J MRC1P25588 1096 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J GPI10P30777 616 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J PSE1P32337 1089 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J ISF1P32488 338 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SWE1P32944 819 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J CSG2P35206 410 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SPT23P35210 1082 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YKT6P36015 200 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SPT8P38915 602 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J DOT6P40059 670 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J DSE1P40077 573 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J UBP7P40453 1071 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J ERG10P41338 398 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J GYP8P43570 497 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J RMD8P43620 662 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR054WP47114 497 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J RSM26P47141 266 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL144CP53907 740 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J EBS1Q03466 884 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J TRE1Q08919 783 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J PIN2Q12057 282 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J GIS3Q12418 502 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL206WQ12424 762 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM3Q99252 613 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J MPD2Q99316 277 aa2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J DDP1Q99321 188 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR422WQ06409 1932 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J JIP3O13555 125 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J MAK16P10962 306 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J COX11P19516 300 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SAT4P25333 603 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J MET4P32389 672 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SMC1P32908 1225 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J CSE1P33307 960 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J NIP100P33420 868 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YET1P35723 206 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J KDX1P36005 433 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J NOP4P37838 685 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J GIP1P38229 639 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR053CP38235 358 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG12P38316 186 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J URA8P38627 578 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J QNS1P38795 714 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J NMD3P38861 518 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J FHL1P39521 936 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J BDH2P39713 417 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SNF7P39929 240 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YEL075CP39972 122 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J PSY2P40164 858 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J DJP1P40564 432 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J UFE1P41834 346 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J LSB3P43603 459 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J STU2P46675 888 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J BFA1P47113 574 aa2.78□□□□□ -1.96
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