RNA–Protein interactions for RNA: YMR093W

UTP15, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP15, Length 1,542 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP15	YMR093W	SWI6	P09959	803 aa		3.62	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	AEP2	P22136	580 aa		3.62	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	HXT7	P39004	570 aa		3.62	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	SEC65	P29478	273 aa		3.61	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	PET127	P32606	800 aa		3.61	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	OAF3	P36023	863 aa		3.61	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	SUL1	P38359	859 aa		3.61	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	BAP3	P41815	604 aa		3.61	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	COX18	P53239	316 aa		3.61	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	YLR407W	Q06070	228 aa		3.61	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	VHS3	Q08438	674 aa		3.61	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	SGO1	Q08490	590 aa		3.61	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	FRE5	Q08908	694 aa		3.61	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	ALG7	P07286	448 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	YKU70	P32807	602 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	YBR053C	P38235	358 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	AIM21	P40563	679 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	FOL1	P53848	824 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	SKY1	Q03656	742 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	ADY4	Q05955	493 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	EMP65	P40085	556 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	HOS4	P40480	1083 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	NIT2	P47016	307 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	YJR120W	P47157	116 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	MSE1	P48525	536 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	COG6	P53959	839 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	YLR040C	Q07988	224 aa		3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
UTP15	YMR093W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	PEX1	P24004	1043 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	REV7	P38927	245 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	NUP60	P39705	539 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	YJL163C	P46996	555 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	DAS1	P47005	663 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	UBC11	P52492	156 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	SLD3	P53135	668 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	MTL1	P53214	551 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	PPN1	Q04119	674 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	YOL073C	Q08232	322 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	YPR027C	Q12079	277 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	TRM13	Q12383	476 aa		3.59	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	SEC15	P22224	910 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	BIT2	P38346	545 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	BCD1	P38772	366 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	DUN1	P39009	513 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	FMP52	P40008	231 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	PEX14	P53112	341 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	SPC105	P53148	917 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	YAP1802	P53309	568 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	KIN4	Q01919	800 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	IRC13	Q08630	104 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	PUS9	Q12069	462 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	KAR1	P11927	433 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	KIN82	P25341	720 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	FAT1	P38225	669 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	FMO1	P38866	432 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	LYS9	P38999	446 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	GET2	P40056	285 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	PXA1	P41909	870 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	IES1	P43579	692 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	SUN4	P53616	420 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	RIA1	P53893	1110 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	NSE5	Q03718	556 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	POM34	Q12445	299 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.57	□□□□□ -1.84	not detected
UTP15	YMR093W	ECM3	Q99252	613 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
UTP15	YMR093W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.9 ms