RNA–Protein interactions for RNA: YKL214C

YRA2, Transcript of Member of the REF (RNA and export factor binding proteins) family, yeast

Gene YRA2, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRA2	YKL214C	PEX28	P38848	579 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	SIT1	P39980	628 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	NTA1	P40354	457 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	SMK1	P41808	388 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	RGD2	P43556	714 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	ALG2	P43636	503 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YGR153W	P48238	217 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	GNP1	P48813	663 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	HST1	P53685	503 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	GAD1	Q04792	585 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	GAS5	Q08193	484 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	REX3	Q12090	404 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PDR10	P51533	1564 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PDR12	Q02785	1511 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	DOP1	Q03921	1698 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PDX1	P16451	410 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	MLS1	P30952	554 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	MDL1	P33310	695 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YEL1	P34225	687 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YKL107W	P34251	309 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	OMA1	P36163	345 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	UBP7	P40453	1071 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	CIR1	P42940	261 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	IRC6	P43615	237 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YGL176C	P46945	554 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	MDE1	P47095	244 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	NUT1	P53114	1132 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PEX15	Q08215	383 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	NFI1	Q12216	726 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	TRM3	Q07527	1436 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	IQG1	Q12280	1495 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	ENA1	P13587	1091 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	PMS1	P14242	873 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	HNM1	P19807	563 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	NIP100	P33420	868 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	KAE1	P36132	386 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	CCZ1	P38273	704 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	MEF2	P39677	819 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	CIT3	P43635	486 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	SPO74	P45819	413 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	POL31	P46957	487 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	MAD3	P47074	515 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	SHE10	P53075	577 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	SPO1	P53541	631 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	YNR061C	P53747	219 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	TEP1	P53916	434 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	TAP42	Q04372	366 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	CIA1	Q05583	330 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	PCL8	Q08966	492 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	IRC20	Q06554	1556 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	HVG1	P0CE11	249 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	FUS1	P11710	512 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	MER1	P16523	270 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
YRA2	YKL214C	REC107	P21651	314 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	DID4	P36108	232 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	HSL7	P38274	827 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	RIP-Chip
YRA2	YKL214C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	KHA1	P40309	873 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	YGL140C	P53120	1219 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	ALF1	P53904	254 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YRA2	YKL214C	ROD1	Q02805	837 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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