RNA–Protein interactions for RNA: YKL146W

AVT3, Transcript of Vacuolar transporter, yeastyeast

Gene AVT3, Length 2,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT3YKL146W SPC72P39723 622 aa5.46□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YER186CP40101 306 aa5.46□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W PHO86P46956 311 aa5.46□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W GCV2P49095 1034 aa5.46□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W ALT1P52893 592 aa5.46□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YGR111WP53265 400 aa5.46□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W CWC22P53333 577 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YNL108CP53929 270 aa5.46□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W WHI5Q12416 295 aa5.46□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YER152CP10356 443 aa5.45□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W PAP1P29468 568 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W GYP6P32806 458 aa5.45□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W RRB1Q04225 511 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W POB3Q04636 552 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W MRX10Q05648 414 aa5.45□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W CIT2P08679 460 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W RRP1P35178 278 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W RRP14P36080 434 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W NCL1P38205 684 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W RRT2P38332 387 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W CBR1P38626 284 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W HIS2P38635 335 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YHL026CP38740 315 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W TDA3P38758 523 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W SNU56Q03782 492 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YDR222WQ04925 415 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W CDD1Q06549 142 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W ZRT2Q12436 422 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W CTF3Q12748 733 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W RSA4P25382 515 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data5.44□□□□□ -1.54not detected
AVT3YKL146W CSE2P33308 149 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W TGL4P36165 910 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W TBS1P38114 1094 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W RCK2P38623 610 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W CCT4P39078 528 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W GEM1P39722 662 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W MAD1P40957 749 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W BRO1P48582 844 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YGR130CP53278 816 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YPR027CQ12079 277 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YOR022CQ12204 715 aa5.44□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YLR462WO13556 202 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W ENO1P00924 437 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W DBF4P32325 704 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W CNS1P33313 385 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YHL049CP38722 271 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YEL075CP39972 122 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YER189WP40104 122 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YFL064CP43540 174 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W RPC17P47076 161 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YJR054WP47114 497 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W STB4P50104 949 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W HOP2P53187 214 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W ALG12P53730 551 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YNL115CP53925 644 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YPL034WQ03083 165 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W ATG16Q03818 150 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W ATG23Q06671 453 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data5.43□□□□□ -1.54not detected
AVT3YKL146W YBL111CQ3E7Y5 667 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W CHS1P08004 1131 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W RPO26P20435 155 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W VPS3P23643 1011 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W PPG1P32838 368 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W HEL1P36113 551 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W NOP4P37838 685 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W ESL1P40456 1118 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W ZAP1P47043 880 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W MND1P53102 219 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data5.43□□□□□ -1.54not detected
AVT3YKL146W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W GYL1Q04322 720 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W ERV41Q04651 352 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W SPO21Q12411 609 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W LDB19Q12502 818 aa5.43□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W JIP3O13555 125 aa5.42□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W BI2P03873 423 aa5.42□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W BI4P03879 638 aa5.42□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W VBA3P25594 458 aa5.42□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W VBA5P36172 582 aa5.42□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YMC2P38087 329 aa5.42□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W AGP2P38090 596 aa5.42□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W PPX1P38698 397 aa5.42□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W QNS1P38795 714 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W YHR219WP38900 624 aa5.42□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W SPO74P45819 413 aa5.42□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W FMP30Q02883 468 aa5.42□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W EEB1Q02891 456 aa5.42□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W URH1Q04179 340 aa5.42□□□□□ -1.54
AVT3YKL146W VTI1Q04338 217 aa5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13 ms